More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1934 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  60.86 
 
 
765 aa  932    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0928  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.28 
 
 
780 aa  885    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  100 
 
 
787 aa  1610    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  60.95 
 
 
749 aa  927    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  60.94 
 
 
765 aa  892    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  37.18 
 
 
721 aa  449  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  37.1 
 
 
772 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.97 
 
 
766 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.01 
 
 
754 aa  425  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  36.74 
 
 
778 aa  422  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  33.2 
 
 
743 aa  422  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  34.18 
 
 
766 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  36.84 
 
 
778 aa  421  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  35.83 
 
 
805 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  37.14 
 
 
772 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.53 
 
 
769 aa  419  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  35.35 
 
 
738 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.18 
 
 
762 aa  417  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  33.92 
 
 
743 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.68 
 
 
751 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  36.64 
 
 
759 aa  411  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  34.99 
 
 
764 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36 
 
 
733 aa  411  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  34.93 
 
 
753 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 
769 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  34.32 
 
 
777 aa  406  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  35.05 
 
 
765 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  35.08 
 
 
764 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  33.33 
 
 
740 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  35.18 
 
 
765 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  35.09 
 
 
763 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  35.25 
 
 
750 aa  405  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  35.19 
 
 
768 aa  405  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  34.7 
 
 
763 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  34.58 
 
 
763 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  34.98 
 
 
763 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  34.06 
 
 
774 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.18 
 
 
768 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.07 
 
 
752 aa  399  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  33.95 
 
 
763 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  32.34 
 
 
755 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  32.34 
 
 
755 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  33.38 
 
 
772 aa  395  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  33.83 
 
 
759 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.75 
 
 
768 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.67 
 
 
804 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  32.34 
 
 
755 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.47 
 
 
733 aa  392  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  32.34 
 
 
755 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.15 
 
 
792 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.96 
 
 
807 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  32.34 
 
 
765 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  32.59 
 
 
790 aa  386  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  36.98 
 
 
764 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.02 
 
 
760 aa  389  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  32.3 
 
 
765 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  32.18 
 
 
765 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.18 
 
 
765 aa  385  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  32.05 
 
 
765 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.21 
 
 
751 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  32.18 
 
 
765 aa  385  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  32.18 
 
 
765 aa  385  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  32.18 
 
 
765 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  32.18 
 
 
765 aa  385  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  32.18 
 
 
765 aa  385  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.5 
 
 
702 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.98 
 
 
784 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.12 
 
 
757 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  33.29 
 
 
739 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.05 
 
 
771 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  32.95 
 
 
727 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  32.66 
 
 
765 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  32.95 
 
 
727 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  32.53 
 
 
751 aa  364  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.49 
 
 
801 aa  363  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  32.45 
 
 
737 aa  362  2e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  31.81 
 
 
743 aa  360  8e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.12 
 
 
736 aa  359  9.999999999999999e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 
782 aa  356  7.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  33.5 
 
 
817 aa  356  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.28 
 
 
742 aa  355  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.27 
 
 
795 aa  354  4e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.5 
 
 
783 aa  353  5.9999999999999994e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.35 
 
 
723 aa  352  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  32.25 
 
 
788 aa  352  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  31.05 
 
 
745 aa  351  4e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.56 
 
 
756 aa  350  6e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.89 
 
 
760 aa  350  8e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.92 
 
 
785 aa  348  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.12 
 
 
773 aa  347  4e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  31.07 
 
 
758 aa  347  4e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  34.81 
 
 
859 aa  347  5e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  34.16 
 
 
802 aa  346  8e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  31.45 
 
 
808 aa  346  8.999999999999999e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.41 
 
 
799 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.92 
 
 
791 aa  345  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.51 
 
 
755 aa  345  2e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2514  glycoside hydrolase family 3 protein  35.86 
 
 
743 aa  344  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0628734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2737  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.99 
 
 
743 aa  343  8e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.728913 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.75 
 
 
762 aa  342  1e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>