More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1886 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  100 
 
 		 506 aa  1017    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  52.58 
 
 		 492 aa  482  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  52.5 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  52.25 
 
 		 490 aa  473  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  54.55 
 
 		 480 aa  474  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  50 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  48.91 
 
 		 479 aa  449  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0644  xylulokinase  52.49 
 
 		 480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632042  normal  0.0960286 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  50.5 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  49.9 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  50.6 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  51.57 
 
 		 505 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  50.4 
 
 		 466 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  51.09 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  49.1 
 
 		 465 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  49.1 
 
 		 465 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  48.9 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  49.1 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  50.19 
 
 		 495 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  50 
 
 		 475 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  50.8 
 
 		 486 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  50.5 
 
 		 479 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  49.3 
 
 		 460 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  47.9 
 
 		 482 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  54.09 
 
 		 472 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  47.32 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  47.2 
 
 		 464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  48.11 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2984  xylulokinase  50.5 
 
 		 482 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.765011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  49.19 
 
 		 469 aa  396  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  47.39 
 
 		 463 aa  381  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  39.3 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  39.3 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  39.51 
 
 		 493 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  34.95 
 
 		 498 aa  237  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7020  carbohydrate kinase FGGY  34.64 
 
 		 540 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  34.1 
 
 		 498 aa  230  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  35.42 
 
 		 495 aa  229  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  32.99 
 
 		 505 aa  224  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  34.1 
 
 		 496 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  33.95 
 
 		 510 aa  219  7.999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  32.78 
 
 		 496 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  33.61 
 
 		 498 aa  217  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  33.26 
 
 		 502 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  33.33 
 
 		 496 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  32.71 
 
 		 493 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  32.51 
 
 		 493 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  31.69 
 
 		 499 aa  202  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  31.39 
 
 		 497 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.87 
 
 		 500 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  31.09 
 
 		 496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  28.17 
 
 		 492 aa  179  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  28.17 
 
 		 492 aa  179  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  28.36 
 
 		 518 aa  170  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  29.87 
 
 		 499 aa  166  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  31.12 
 
 		 498 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  29.71 
 
 		 501 aa  163  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  27.91 
 
 		 509 aa  159  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.54 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  26.03 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  26.8 
 
 		 490 aa  153  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  28.89 
 
 		 509 aa  153  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  29.63 
 
 		 512 aa  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  31.17 
 
 		 506 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  29.33 
 
 		 488 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  29.35 
 
 		 488 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  27.35 
 
 		 499 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  29.01 
 
 		 486 aa  148  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  28.91 
 
 		 488 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  28.16 
 
 		 511 aa  147  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  28.91 
 
 		 488 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  27.71 
 
 		 484 aa  146  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  30.69 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  26.77 
 
 		 496 aa  144  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  30.33 
 
 		 481 aa  144  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  27.31 
 
 		 509 aa  143  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  28.46 
 
 		 489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  24.69 
 
 		 489 aa  141  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  27.96 
 
 		 515 aa  140  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  28.7 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  27.83 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  30.69 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  32.96 
 
 		 499 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  28.93 
 
 		 484 aa  136  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  31.4 
 
 		 493 aa  136  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  29.13 
 
 		 484 aa  136  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  29.13 
 
 		 484 aa  136  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  28.93 
 
 		 484 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  28.93 
 
 		 484 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  29.04 
 
 		 486 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  28.93 
 
 		 484 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0177  xylulokinase  28.04 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  28.48 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  28.26 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  29.48 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  29.9 
 
 		 484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  29.03 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  29.51 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  28.93 
 
 		 484 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  28.38 
 
 		 475 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>