41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1814 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  100 
 
 
482 aa  976    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  48.28 
 
 
381 aa  87.4  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  42.73 
 
 
143 aa  86.7  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  41.59 
 
 
143 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  41.59 
 
 
143 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  42.72 
 
 
468 aa  80.5  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  40.87 
 
 
512 aa  77.8  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.82 
 
 
655 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  33.33 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  42.31 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  39.47 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.53 
 
 
619 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  41.28 
 
 
933 aa  69.7  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.53 
 
 
619 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  41.41 
 
 
449 aa  68.2  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  42.86 
 
 
266 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  40.48 
 
 
265 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  40.48 
 
 
265 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  40.71 
 
 
318 aa  64.7  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.82 
 
 
574 aa  63.2  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  30.36 
 
 
279 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  30.36 
 
 
279 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  36.9 
 
 
324 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  31.3 
 
 
156 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 
300 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 
300 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  33.72 
 
 
582 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  34.48 
 
 
334 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  34.48 
 
 
334 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  39.08 
 
 
447 aa  51.2  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  30.97 
 
 
157 aa  50.1  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  27.39 
 
 
1160 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  27.4 
 
 
258 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  27.66 
 
 
214 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  27.46 
 
 
438 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4551  CHAP domain containing protein  37.88 
 
 
357 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.374294 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  29.5 
 
 
368 aa  44.3  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2588  CHAP domain-containing protein  33.63 
 
 
255 aa  44.3  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2642  CHAP domain-containing protein  33.63 
 
 
255 aa  44.3  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  34.55 
 
 
397 aa  43.9  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  30.07 
 
 
285 aa  43.5  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>