77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1758 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  100 
 
 
279 aa  566  1e-160  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  42.24 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  35.48 
 
 
280 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  31.62 
 
 
311 aa  188  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  31.25 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  33.45 
 
 
282 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  33.09 
 
 
282 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  31.02 
 
 
279 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  32.61 
 
 
276 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  29.86 
 
 
278 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  29.86 
 
 
278 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  32.61 
 
 
276 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  34.06 
 
 
276 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  29.14 
 
 
278 aa  155  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  29.14 
 
 
278 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  29.14 
 
 
278 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  29.14 
 
 
278 aa  155  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  31.39 
 
 
278 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  29.45 
 
 
275 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  32.5 
 
 
283 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  29.3 
 
 
285 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  29.39 
 
 
282 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  30.07 
 
 
287 aa  152  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  29.03 
 
 
282 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  28.36 
 
 
282 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  28 
 
 
282 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  28.36 
 
 
282 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  28.36 
 
 
282 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  28.36 
 
 
282 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  28 
 
 
282 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  28 
 
 
282 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  29.2 
 
 
287 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  28 
 
 
282 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  30.53 
 
 
289 aa  149  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  29.64 
 
 
277 aa  148  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  28.21 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  30.11 
 
 
278 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  31.02 
 
 
276 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  29.93 
 
 
281 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  29.82 
 
 
285 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  25.99 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  28.1 
 
 
282 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  29.5 
 
 
284 aa  138  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  27.37 
 
 
282 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  26.33 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  30.63 
 
 
286 aa  136  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  30.83 
 
 
278 aa  136  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  31.54 
 
 
281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  30.77 
 
 
292 aa  132  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  26.79 
 
 
283 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  26.41 
 
 
279 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  32.16 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  26.86 
 
 
285 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  27.57 
 
 
276 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  27.44 
 
 
279 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  25.09 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  26.55 
 
 
282 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  27.34 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  27.34 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  26.16 
 
 
281 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  30.84 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  26.55 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  24.22 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  21.63 
 
 
279 aa  90.1  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  29.22 
 
 
164 aa  85.5  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  23.43 
 
 
692 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  30.51 
 
 
977 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  21.39 
 
 
651 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  21.39 
 
 
651 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  24.04 
 
 
741 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  41.18 
 
 
674 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0261  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  24.53 
 
 
901 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0929  transcriptional antiterminator  22.79 
 
 
663 aa  46.2  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  20.72 
 
 
661 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.03 
 
 
625 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  22.66 
 
 
652 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2796  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  22.28 
 
 
696 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>