251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1730 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1730  50S ribosomal protein L36  100 
 
 
37 aa  74.3  5e-13  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.544238  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0274  ribosomal protein L36  97.3 
 
 
37 aa  73.9  6e-13  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3899  50S ribosomal protein L36  86.49 
 
 
37 aa  65.9  2e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4290  50S ribosomal protein L36  86.49 
 
 
37 aa  66.2  2e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.856971  hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23560  LSU ribosomal protein L36P  83.78 
 
 
37 aa  64.7  4e-10  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0610  ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  64.7  4e-10  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675982  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1432  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  64.3  6e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.846939  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1138  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  64.3  6e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.353832 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4294  ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  63.9  6e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1126  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  64.3  6e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.384917  normal  0.806869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1109  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  64.3  6e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2658  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  63.9  7e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3879  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  63.9  7e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2943  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  63.9  7e-10  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.702617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0446  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  63.5  8e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250661  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13498  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  63.5  9e-10  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03834e-12  normal  0.841805 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2883  ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  63.5  1e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472397  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4483  ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  63.2  1e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.884405  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23231  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  63.2  1e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2991  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  62.8  1e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6587  ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  62.4  2e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.184599  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0330  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  62.4  2e-09  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.121743  decreased coverage  0.000353679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1168  ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  62.4  2e-09  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29490  LSU ribosomal protein L36P  81.08 
 
 
37 aa  62.4  2e-09  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144849  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1975  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  62.8  2e-09  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.341168  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0651  ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  62.4  2e-09  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0606  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  62.4  2e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1114  LSU ribosomal protein L36P  81.08 
 
 
37 aa  62.4  2e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323838  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1363  ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  62  2e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0960  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  62.4  2e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3724  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  62.4  2e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0589  50S ribosomal protein L36  83.78 
 
 
37 aa  62.8  2e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314897  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19750  LSU ribosomal protein L36P  72.97 
 
 
37 aa  61.6  3e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00973843  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2808  ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  61.6  3e-09  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  3.1585e-08  hitchhiker  1.95432e-08 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0712  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  62  3e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.22177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04220  LSU ribosomal protein L36P  78.38 
 
 
37 aa  61.6  3e-09  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.383855  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16930  LSU ribosomal protein L36P  78.38 
 
 
37 aa  62  3e-09  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5149  ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  62  3e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.982294  normal  0.58314 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0356  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  61.6  3e-09  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1313  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  61.6  3e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1500  ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  61.6  4e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2621  50S ribosomal protein L36P  78.38 
 
 
37 aa  61.2  5e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.775374  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1137  ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  61.2  5e-09  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  9.48568e-05  normal  0.0431447 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01410  LSU ribosomal protein L36P  72.97 
 
 
37 aa  61.2  5e-09  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0615233  normal  0.988517 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0712  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  60.8  6e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  8.97597e-12  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1844  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  60.8  7e-09  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0783  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  60.5  8e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.59865e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2629  ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  60.1  9e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3116  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  60.5  9e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20630  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  60.1  9e-09  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0927005  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0228  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  60.1  1e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000229523  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0891  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
46 aa  60.1  1e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.31668e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  60.1  1e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0422  ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  60.1  1e-08  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2212  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  59.7  1e-08  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2928  50S ribosomal protein L36P  78.38 
 
 
37 aa  60.1  1e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.66918e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0131  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  59.7  1e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0135  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 
37 aa  59.7  1e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  5.44663e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0239  ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  59.3  2e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.36558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2254  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  59.3  2e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.031997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0147  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  58.9  2e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.12263e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0129  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  58.9  2e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  2.56453e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0134  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  58.9  2e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  3.70464e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0673  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  59.3  2e-08  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2435  50S ribosomal protein L36P  72.97 
 
 
37 aa  59.3  2e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0134  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  58.9  2e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.59477e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0155  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  58.9  2e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  6.28641e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2374  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  59.3  2e-08  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0128  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  58.9  2e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.90625e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0134  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  58.9  2e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  8.09318e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2689  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  59.3  2e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1808  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  59.3  2e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0165  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  58.9  2e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.1135e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3386  ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  59.3  2e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2295  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  59.3  2e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3673  ribosomal protein L36  81.08 
 
 
37 aa  59.3  2e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5171  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  58.9  2e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.96935e-11  unclonable  4.53909e-26 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl147  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  58.2  3e-08  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.31262e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0313  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  57.8  4e-08  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00358606  unclonable  6.93478e-29 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2580  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  57.8  5e-08  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2687  ribosomal protein L36  75.68 
 
 
37 aa  57.8  5e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00180779  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17201  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  57.8  6e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1884  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
38 aa  57.4  7e-08  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  3.86083e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0081  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
38 aa  57.4  7e-08  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  2.65715e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4221  ribosomal protein L36  75.68 
 
 
43 aa  57.4  7e-08  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2378  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
38 aa  57.4  7e-08  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2308  ribosomal protein L36  70.27 
 
 
37 aa  57  8e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000112956  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1004  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 
37 aa  57  9e-08  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  5.66406e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0341  50S ribosomal protein L36P  75.68 
 
 
37 aa  57  9e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.97452e-05  unclonable  3.32549e-08 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1460  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
39 aa  56.6  1e-07  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  2.82576e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3927  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  56.6  1e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0219  LSU ribosomal protein L36P  70.27 
 
 
38 aa  56.6  1e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1213  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  56.6  1e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1551  ribosomal protein L36  64.86 
 
 
37 aa  56.2  1e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0249  ribosomal protein L36  67.57 
 
 
37 aa  56.6  1e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.07558e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0617  50S ribosomal protein L36P  73.68 
 
 
39 aa  55.8  2e-07  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  4.6769e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2595  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 
37 aa  55.8  2e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0561863  normal  0.639398 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2610  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  55.8  2e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.142007  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3503  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 
37 aa  55.8  2e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  9.92018e-05  hitchhiker  7.44799e-08 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1721  ribosomal protein L36  70.27 
 
 
37 aa  56.2  2e-07  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  5.18993e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>