More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1729 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1729  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 72 aa  147  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.616662  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16940  translation initiation factor 1  81.43 
 
 		 76 aa  122  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2659  translation initiation factor IF-1  82.86 
 
 		 73 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2944  translation initiation factor IF-1  82.86 
 
 		 73 aa  123  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29500  translation initiation factor 1  81.43 
 
 		 73 aa  120  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2630  translation initiation factor IF-1  81.43 
 
 		 73 aa  120  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13499  translation initiation factor IF-1 infA  80 
 
 		 116 aa  120  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3117  translation initiation factor IF-1  80 
 
 		 73 aa  120  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0650  translation initiation factor IF-1  80 
 
 		 73 aa  120  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6588  translation initiation factor IF-1  81.43 
 
 		 73 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0711  translation initiation factor IF-1  80 
 
 		 73 aa  119  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0609  translation initiation factor IF-1  81.43 
 
 		 73 aa  119  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20640  translation initiation factor 1  77.14 
 
 		 73 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.355851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1108  translation initiation factor IF-1  80 
 
 		 73 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1137  translation initiation factor IF-1  80 
 
 		 73 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3674  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1125  translation initiation factor IF-1  80 
 
 		 73 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.609417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1431  translation initiation factor IF-1  80 
 
 		 73 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04210  translation initiation factor IF-1  80 
 
 		 73 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.554709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3388  translation initiation factor IF-1  80 
 
 		 73 aa  118  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4974  translation initiation factor IF-1  80 
 
 		 73 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1167  translation initiation factor IF-1  81.43 
 
 		 73 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3880  translation initiation factor IF-1  80 
 
 		 73 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3900  translation initiation factor IF-1  77.14 
 
 		 153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23570  translation initiation factor 1  80 
 
 		 73 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4484  translation initiation factor IF-1  80 
 
 		 73 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75714  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  80 
 
 		 73 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 		 72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2379  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 		 72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001894  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0605  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 		 73 aa  117  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 		 73 aa  117  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6026  translation initiation factor IF-1  78.57 
 
 		 73 aa  117  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 		 72 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0080  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000359666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 		 72 aa  115  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1885  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000423872  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  77.14 
 
 		 73 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4291  translation initiation factor IF-1  77.14 
 
 		 73 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.525945  hitchhiker  0.00108968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 		 73 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1212  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 		 73 aa  114  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 		 73 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  77.14 
 
 		 73 aa  114  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  75 
 
 		 72 aa  113  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  76.39 
 
 		 73 aa  113  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 		 72 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0959  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 		 73 aa  112  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  73.61 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 		 73 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 		 72 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000018307  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0055  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  110  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1755  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  110  7.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0524428  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  110  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1138  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  110  9e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000117845  normal  0.0449626 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1012  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631834  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 75 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0307  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0090  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.146045  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 73 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  70.83 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0209  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  73.24 
 
 		 73 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  65.28 
 
 		 87 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0376  translation initiation factor IF-1  69.01 
 
 		 71 aa  107  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  107  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 72 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.453286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>