More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1722 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1722  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  357  5e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0239785  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0266  ribosomal protein L6  81.01 
 
 		 179 aa  296  1e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  55.93 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  55.37 
 
 		 178 aa  197  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  56.5 
 
 		 181 aa  195  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  57.3 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 179 aa  187  8e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 178 aa  187  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 178 aa  187  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  52.25 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 		 180 aa  185  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  184  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  184  8e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 179 aa  184  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  184  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  51.12 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  53.37 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  180  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  180  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  180  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  47.7 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  48.59 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 180 aa  175  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  47.13 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 181 aa  174  6e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 180 aa  173  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  46.55 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  46.55 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  45.4 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  51.96 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 177 aa  170  9e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1860  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1689  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.267616  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  44.63 
 
 		 180 aa  169  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 178 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  45.98 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 180 aa  167  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  167  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  167  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0492  ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 178 aa  167  9e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  46.55 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2066  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 178 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  46.55 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0074  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 178 aa  164  4e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  48.82 
 
 		 182 aa  165  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 178 aa  164  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  46.55 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  46.55 
 
 		 177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 180 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  46.59 
 
 		 177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  46.55 
 
 		 177 aa  164  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  49.71 
 
 		 183 aa  164  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  51.15 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  48.91 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  45.98 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  50.81 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  48.82 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  46.55 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  45.88 
 
 		 182 aa  161  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  44.83 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  46.2 
 
 		 185 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>