160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1630 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  369  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  45.37 
 
 
216 aa  135  4e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  40.23 
 
 
182 aa  91.3  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  40.53 
 
 
215 aa  88.2  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  42.41 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  42.41 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  38.71 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  41.25 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  38.75 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  39.86 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  39.16 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  36 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  38.42 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  34.87 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  38.73 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  35.33 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  41.18 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  35.33 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  34.62 
 
 
203 aa  72  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  38.73 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  36.42 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  42.55 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  38.62 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  53.95 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  33.98 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  37.16 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  38.93 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  37.74 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  40.14 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  37.58 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  36 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  36 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  36.02 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  34.67 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  36.42 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  37.35 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  41.01 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  34.34 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  37.24 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  36 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  36 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  31.82 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  36 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  33.73 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  37.06 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  37.27 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  59.09 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  39.44 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  32.32 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  34.42 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  37.41 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  34.62 
 
 
169 aa  63.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  36.68 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  36.6 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  32.28 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  37.35 
 
 
202 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  37.35 
 
 
202 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  37.35 
 
 
202 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  36.48 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  32.37 
 
 
174 aa  62.4  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3071  BioY protein  45 
 
 
204 aa  61.6  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  56.72 
 
 
189 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  37.14 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  35.26 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  36.18 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  33.87 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  40.38 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  38.78 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  31.17 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  33.33 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  34 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  33.5 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  42.15 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  36.91 
 
 
180 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  40.52 
 
 
196 aa  58.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  49.49 
 
 
225 aa  58.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  43.37 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  33.56 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  37.09 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  35.44 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2086  BioY protein  40.28 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00325943  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  32 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  45.21 
 
 
191 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  37.75 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  45.21 
 
 
191 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  50.57 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  31.74 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  37.66 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  34.46 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  36.36 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  33.33 
 
 
179 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  36.11 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  38.96 
 
 
202 aa  55.5  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  36.55 
 
 
169 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  42.39 
 
 
189 aa  55.1  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  33.51 
 
 
194 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  31.71 
 
 
194 aa  55.5  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  45.78 
 
 
190 aa  55.5  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  31.47 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  38.18 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>