More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1615 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  85.59 
 
 		 1093 aa  969    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  66.52 
 
 		 1265 aa  659    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  100 
 
 		 1022 aa  2029    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  67.46 
 
 		 1043 aa  652    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  62.72 
 
 		 1117 aa  647    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  66.01 
 
 		 952 aa  638    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  65.32 
 
 		 944 aa  646    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  65.87 
 
 		 1018 aa  630  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  59.8 
 
 		 1113 aa  620  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  62.55 
 
 		 1151 aa  618  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  62.37 
 
 		 1334 aa  618  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  63.38 
 
 		 990 aa  616  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  62.8 
 
 		 1041 aa  609  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  62.23 
 
 		 1091 aa  607  9.999999999999999e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  60.98 
 
 		 922 aa  607  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  61.49 
 
 		 908 aa  600  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  58.63 
 
 		 1040 aa  601  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  60.46 
 
 		 1007 aa  602  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  62.05 
 
 		 1070 aa  600  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  61.24 
 
 		 959 aa  592  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  60.72 
 
 		 1427 aa  593  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  61.59 
 
 		 1093 aa  595  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  60.93 
 
 		 1194 aa  594  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  59.92 
 
 		 1048 aa  593  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  63.09 
 
 		 1244 aa  594  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  62.5 
 
 		 702 aa  594  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  61.84 
 
 		 1024 aa  592  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  61.76 
 
 		 1058 aa  588  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  52.98 
 
 		 1123 aa  582  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  60.94 
 
 		 974 aa  582  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  58.63 
 
 		 1080 aa  582  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  56.5 
 
 		 987 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  56.5 
 
 		 991 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  56.5 
 
 		 991 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  54.44 
 
 		 961 aa  560  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  55.35 
 
 		 1016 aa  560  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  53.94 
 
 		 953 aa  551  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  58.17 
 
 		 717 aa  537  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  49.26 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  40.27 
 
 		 564 aa  324  6e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  40.48 
 
 		 559 aa  324  6e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  40.43 
 
 		 562 aa  317  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  40.53 
 
 		 494 aa  313  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  42.5 
 
 		 636 aa  312  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  43.58 
 
 		 571 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  40 
 
 		 543 aa  304  7.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  41.26 
 
 		 531 aa  303  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  39.91 
 
 		 496 aa  298  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  39.15 
 
 		 492 aa  297  6e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  38.57 
 
 		 503 aa  295  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  39.67 
 
 		 496 aa  295  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  41.71 
 
 		 497 aa  293  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  37.96 
 
 		 503 aa  292  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  36.71 
 
 		 1056 aa  288  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  39.07 
 
 		 500 aa  287  8e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  41.05 
 
 		 497 aa  287  8e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  40.81 
 
 		 497 aa  285  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  40.29 
 
 		 489 aa  285  4.0000000000000003e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  39.22 
 
 		 483 aa  284  5.000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  42.05 
 
 		 485 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  41.91 
 
 		 485 aa  283  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0282  ribonuclease  36.34 
 
 		 1449 aa  281  3e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.936888  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  35.8 
 
 		 1175 aa  281  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  39.86 
 
 		 489 aa  281  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0256  RNAse E  36.1 
 
 		 1405 aa  280  7e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  39.24 
 
 		 411 aa  279  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  40.44 
 
 		 489 aa  278  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  42.16 
 
 		 487 aa  277  8e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  38.65 
 
 		 492 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  37.86 
 
 		 499 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0479  ribonuclease  36.1 
 
 		 1368 aa  275  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  35.75 
 
 		 528 aa  275  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  37.62 
 
 		 489 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  36.52 
 
 		 1012 aa  274  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1619  RNAse E  37.12 
 
 		 968 aa  274  8.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000868095  normal  0.696665 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  36.65 
 
 		 528 aa  273  9e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0042  ribonuclease, Rne/Rng family  38.59 
 
 		 645 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754542 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  38.34 
 
 		 503 aa  273  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  36.06 
 
 		 517 aa  272  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  37.53 
 
 		 489 aa  272  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  37.53 
 
 		 489 aa  273  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  36 
 
 		 496 aa  273  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  35.11 
 
 		 476 aa  273  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  36 
 
 		 496 aa  273  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1093  ribonuclease, Rne/Rng family  38.1 
 
 		 653 aa  272  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1064  ribonuclease, Rne/Rng family  38.1 
 
 		 653 aa  272  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  41.03 
 
 		 492 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  40.54 
 
 		 474 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  35.27 
 
 		 530 aa  271  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1378  ribonuclease, Rne/Rng family  35.87 
 
 		 1074 aa  270  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  36.12 
 
 		 1057 aa  270  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2176  ribonuclease E  37.17 
 
 		 1132 aa  270  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0818  ribonuclease  36.1 
 
 		 1092 aa  270  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00158382  normal  0.513461 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  41.03 
 
 		 485 aa  270  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1989  ribonuclease E  35.31 
 
 		 1141 aa  270  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378047  normal  0.0201653 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2863  ribonuclease E  35.63 
 
 		 1088 aa  270  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.829315  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  36.02 
 
 		 1128 aa  270  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4788  ribonuclease  35.78 
 
 		 1038 aa  269  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.870424  normal  0.38307 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  40.64 
 
 		 490 aa  269  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0274  ribonuclease G  39.07 
 
 		 491 aa  269  2e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>