More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1603 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1603  putative permease  100 
 
 		 421 aa  831    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  34.75 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 414 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  34 
 
 		 415 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  34.55 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  34.55 
 
 		 417 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  34.55 
 
 		 417 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  34.55 
 
 		 417 aa  203  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 		 415 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2733  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 424 aa  153  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 		 405 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  26.34 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  25.74 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  25.5 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  25.74 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  25.5 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  25.74 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  26.28 
 
 		 434 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  25.93 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  26.05 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  24.69 
 
 		 422 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 422 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1443  ABC transporter, permease protein, putative  29.46 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05510  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 446 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354906  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  24.44 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.24 
 
 		 422 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.21 
 
 		 422 aa  106  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.69 
 
 		 422 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  24.57 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.44 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.44 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  24.15 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  26.87 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  26.3 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  27.11 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  26.25 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.68 
 
 		 1833 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  26.3 
 
 		 408 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 439 aa  96.3  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0293  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  23.21 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.83 
 
 		 408 aa  93.2  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.83 
 
 		 408 aa  93.2  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  27.59 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 440 aa  87.8  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25 
 
 		 436 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 412 aa  87  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.63 
 
 		 410 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  25.59 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  27.24 
 
 		 1816 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  25.47 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  23.37 
 
 		 393 aa  82.8  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.37 
 
 		 2720 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  28.42 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  24.83 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  30.71 
 
 		 495 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  24.36 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  24.77 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  24.36 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  24.77 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  24.77 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.6 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  24.77 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  24.36 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 438 aa  76.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  24.69 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.87 
 
 		 1776 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2640  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>