289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1588 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 		 159 aa  322  1e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  66.67 
 
 		 159 aa  224  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  62.89 
 
 		 159 aa  204  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  61.64 
 
 		 159 aa  202  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  61.64 
 
 		 159 aa  197  7e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 		 159 aa  197  7e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 		 159 aa  197  7e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  61.01 
 
 		 159 aa  196  9e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 		 159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  59.75 
 
 		 177 aa  191  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  57.86 
 
 		 159 aa  190  8e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  52.2 
 
 		 159 aa  181  5.0000000000000004e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  50.94 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  53.46 
 
 		 159 aa  175  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  53.46 
 
 		 159 aa  175  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  53.46 
 
 		 159 aa  175  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  53.46 
 
 		 159 aa  175  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  54.09 
 
 		 159 aa  174  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  53.46 
 
 		 159 aa  175  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  54.09 
 
 		 159 aa  174  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  53.46 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  54.09 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 		 159 aa  174  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 		 159 aa  173  7e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 		 167 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 		 167 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  50.94 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  48.43 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  49.38 
 
 		 159 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  49.69 
 
 		 159 aa  161  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  49.69 
 
 		 160 aa  160  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  45.91 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  49.06 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  49.69 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  47.8 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  50.62 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  48.43 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  43.67 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  45.28 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  47.17 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  44.03 
 
 		 159 aa  134  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  45.28 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  46.98 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000321376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  41.14 
 
 		 156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  41.51 
 
 		 145 aa  124  7e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  43.95 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  38.36 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  39.62 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  42.77 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  41.77 
 
 		 154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  40.51 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  38.12 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000120768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  37.34 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  34.81 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  39.24 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  35.85 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  39.87 
 
 		 153 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  36.08 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2599  hypothetical protein  53.66 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  36.88 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  36.71 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  37.11 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  38.51 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  39.87 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  37.74 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  37.74 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  35 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3345  hypothetical protein  37.42 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  38.89 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  38.99 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  39.74 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  36.08 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0083  hypothetical protein  36.08 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000837778  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  36.71 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  34.21 
 
 		 145 aa  99  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  39.87 
 
 		 153 aa  99  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  34.16 
 
 		 162 aa  98.2  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  39.74 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 		 156 aa  97.1  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1654  hypothetical protein  36.65 
 
 		 153 aa  97.1  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  37.65 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  36.25 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  32.5 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  34.59 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  38.85 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  37.04 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>