More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1586 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1586  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
369 aa  753  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0087  tRNA synthetase class I (E and Q), catalytic domain protein  46.34 
 
 
374 aa  304  1e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62423e-07 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  41.33 
 
 
311 aa  261  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  2.57577e-07  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  41.57 
 
 
313 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
318 aa  217  3e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
317 aa  209  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  37.04 
 
 
331 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  39.6 
 
 
323 aa  201  1e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  35.98 
 
 
334 aa  198  1e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  38.51 
 
 
337 aa  197  2e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  39.14 
 
 
323 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 
329 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  34.65 
 
 
373 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2904  glutamate--tRNA ligase  36.28 
 
 
338 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.437681  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  34.67 
 
 
330 aa  190  3e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  38.99 
 
 
314 aa  189  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  39.89 
 
 
323 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3343  Glutamate--tRNA ligase  35.23 
 
 
338 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
301 aa  186  7e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  36.71 
 
 
327 aa  184  1e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  36.96 
 
 
314 aa  184  2e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3126  Glutamate--tRNA ligase  39.87 
 
 
307 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216069  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2081  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.57 
 
 
294 aa  180  3e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178855  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  38.67 
 
 
311 aa  179  6e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.86478e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1251  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  37.97 
 
 
296 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3294  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  37.76 
 
 
296 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0962  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.57 
 
 
298 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294785  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3769  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  37.62 
 
 
301 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0219396 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1109  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.07 
 
 
299 aa  176  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1982  glutamate--tRNA ligase  36.69 
 
 
323 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193008  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2315  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  37.88 
 
 
298 aa  174  1e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0827  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.57 
 
 
297 aa  175  1e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.292279  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1041  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.57 
 
 
297 aa  175  1e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.512398  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1915  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.57 
 
 
297 aa  175  1e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00194048  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1195  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.57 
 
 
297 aa  175  1e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0519068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1203  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.57 
 
 
297 aa  175  1e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1353  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.57 
 
 
297 aa  175  1e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2934  glutamate--tRNA ligase  37.71 
 
 
327 aa  175  1e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0900886  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0324  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.57 
 
 
297 aa  175  1e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1703  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  37.88 
 
 
298 aa  174  1e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  36.75 
 
 
311 aa  174  2e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.78146e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1905  glutamate--tRNA ligase  37.71 
 
 
309 aa  174  3e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2338  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  37.54 
 
 
298 aa  173  4e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2408  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  37.71 
 
 
314 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1782  Glutamate--tRNA ligase  37.31 
 
 
323 aa  172  7e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2234  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  37.12 
 
 
294 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2014  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  35.9 
 
 
311 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  38.08 
 
 
319 aa  169  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0982  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  37.54 
 
 
297 aa  169  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1882  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  37.76 
 
 
295 aa  168  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3639  Glutamate--tRNA ligase  37.85 
 
 
318 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0605  glutamate--tRNA ligase  35.23 
 
 
316 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4694  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  35.52 
 
 
300 aa  167  3e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0797  glutamate--tRNA ligase  35.47 
 
 
303 aa  167  3e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.76322e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4692  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  35.22 
 
 
295 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  6.87127e-06 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4558  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  35.28 
 
 
300 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.48174e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0740  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  34.99 
 
 
295 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  6.57167e-09 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5657  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  36.86 
 
 
297 aa  165  1e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4720  glutamate--tRNA ligase  37.07 
 
 
292 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  37.91 
 
 
297 aa  163  4e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4805  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  37.29 
 
 
298 aa  163  4e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167775  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  38.21 
 
 
302 aa  163  5e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3032  glutamate--tRNA ligase  38.08 
 
 
335 aa  163  5e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490403  normal  0.333291 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  38.64 
 
 
283 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2210  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  36.36 
 
 
315 aa  162  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.895513  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4049  glutamate--tRNA ligase  37.01 
 
 
312 aa  162  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963278  normal  0.0953958 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
498 aa  161  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0900  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.64 
 
 
301 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2581  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  37.5 
 
 
310 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1285  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  35.74 
 
 
277 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3586  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  36.15 
 
 
294 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1474  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  36.92 
 
 
287 aa  159  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104503  normal  0.08026 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02670  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
328 aa  159  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 
535 aa  159  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0414  Glutamate--tRNA ligase  35.4 
 
 
309 aa  159  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0967  glutamyl-tRNA synthetase-related protein  36.27 
 
 
295 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3073  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  32.03 
 
 
310 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1164  glutamate--tRNA ligase  37.62 
 
 
276 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647916  normal  0.361604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2628  glutamyl-/ glutaminyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 
277 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3734  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  35.53 
 
 
293 aa  156  5e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2354  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  36.79 
 
 
297 aa  156  5e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0532352  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  37.74 
 
 
303 aa  156  5e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  3.45941e-06 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42650  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  35.86 
 
 
298 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.404894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0153  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  35.59 
 
 
308 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  2.16792e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3515  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  35.59 
 
 
308 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000809743  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3371  glutamate--tRNA ligase  35.14 
 
 
309 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00143  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  35.59 
 
 
308 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  9.65107e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3985  glutamate--tRNA ligase  36.89 
 
 
298 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00142  hypothetical protein  35.59 
 
 
308 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  7.3692e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62510  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  35.35 
 
 
293 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.632499  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  35.88 
 
 
313 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0147  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  35.59 
 
 
308 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.35998e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0135  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  34.91 
 
 
308 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  9.52983e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1188  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  32.96 
 
 
310 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0787184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0834  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  36.15 
 
 
295 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3458  Glutamate--tRNA ligase  35.59 
 
 
308 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.33336e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0155  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  34.92 
 
 
308 aa  154  3e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  3.30797e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1393  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  34.16 
 
 
282 aa  152  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0851  Glutamate--tRNA ligase  35.29 
 
 
313 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.31695  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0148  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  35.25 
 
 
308 aa  152  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  1.29858e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>