59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1547 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  100 
 
 
344 aa  711  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  6.31807e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  55.99 
 
 
340 aa  378  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  57.1 
 
 
316 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  56.15 
 
 
316 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  56.78 
 
 
316 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  56.78 
 
 
316 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  56.15 
 
 
316 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  56.15 
 
 
316 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  54.55 
 
 
341 aa  365  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  53.31 
 
 
580 aa  348  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.11 
 
 
316 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.6 
 
 
648 aa  337  1e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.57 
 
 
505 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.75 
 
 
315 aa  330  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.61 
 
 
315 aa  309  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.96 
 
 
315 aa  308  7e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.81 
 
 
314 aa  308  1e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.08 
 
 
392 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.44 
 
 
378 aa  298  9e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  50.32 
 
 
362 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  2.45228e-11  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.44 
 
 
378 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.48 
 
 
426 aa  296  3e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  46.47 
 
 
377 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.83532e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.34 
 
 
369 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.11 
 
 
333 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.11 
 
 
333 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  44.11 
 
 
333 aa  266  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.71617e-06 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.38 
 
 
350 aa  226  5e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.22 
 
 
340 aa  198  1e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.28 
 
 
376 aa  189  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.95 
 
 
347 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.35 
 
 
466 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  35.19 
 
 
349 aa  164  2e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  35.45 
 
 
329 aa  159  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  34.76 
 
 
355 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  32.51 
 
 
607 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.48 
 
 
355 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.44 
 
 
353 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.11 
 
 
507 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.69 
 
 
517 aa  147  2e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.13 
 
 
628 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  33.23 
 
 
627 aa  145  7e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.34172e-05  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  32.94 
 
 
502 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  33.53 
 
 
634 aa  142  1e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  3.21687e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  33.53 
 
 
634 aa  141  2e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  33.53 
 
 
634 aa  141  2e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  7.18487e-06  hitchhiker  3.98389e-05 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  31.34 
 
 
2073 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  29.11 
 
 
710 aa  99.8  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  25.32 
 
 
1278 aa  89.7  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  24.09 
 
 
315 aa  74.3  3e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  25.8 
 
 
713 aa  67  5e-10  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 
310 aa  62  1e-08  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  23.29 
 
 
393 aa  51.6  2e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 
340 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  23.77 
 
 
545 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  24.32 
 
 
384 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  24.01 
 
 
495 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  22.15 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  27.66 
 
 
586 aa  42.7  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>