48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1542 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  100 
 
 
581 aa  1189    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  46.1 
 
 
531 aa  458  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  34.01 
 
 
848 aa  207  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 
471 aa  171  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  32.88 
 
 
471 aa  170  8e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  31.7 
 
 
1121 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  32.62 
 
 
1121 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  32.64 
 
 
1121 aa  167  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  30.93 
 
 
476 aa  156  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  31.37 
 
 
475 aa  156  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  25.71 
 
 
707 aa  153  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  27.71 
 
 
1143 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.57 
 
 
810 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  32.63 
 
 
1112 aa  147  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  26.67 
 
 
789 aa  144  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  29.37 
 
 
804 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  29.35 
 
 
703 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  28.43 
 
 
1174 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  25.49 
 
 
494 aa  123  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  29.35 
 
 
488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  27.51 
 
 
472 aa  107  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.84 
 
 
341 aa  86.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.57 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  26.57 
 
 
315 aa  82  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  25.97 
 
 
456 aa  81.3  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  28.09 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.63 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.34 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.34 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  28.57 
 
 
598 aa  73.6  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  27.56 
 
 
491 aa  73.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.47 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.96 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.92 
 
 
346 aa  64.3  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  25.3 
 
 
537 aa  63.9  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.56 
 
 
366 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.61 
 
 
319 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.4 
 
 
472 aa  61.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.32 
 
 
343 aa  56.6  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.89 
 
 
334 aa  57  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  31.82 
 
 
480 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  20.9 
 
 
503 aa  52.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.18 
 
 
379 aa  50.4  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  28.47 
 
 
510 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  25.42 
 
 
386 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  22.52 
 
 
553 aa  47.8  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 
492 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  24.17 
 
 
829 aa  44.3  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>