52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1538 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  100 
 
 		 469 aa  956    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  57.11 
 
 		 424 aa  465  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  52.84 
 
 		 440 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  54.73 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  53.61 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  59.2 
 
 		 445 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  55.01 
 
 		 442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  58.43 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  46.15 
 
 		 433 aa  339  7e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  47.44 
 
 		 587 aa  337  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  46.99 
 
 		 446 aa  330  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  41.05 
 
 		 453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  42.27 
 
 		 445 aa  270  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  30.15 
 
 		 583 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  29.18 
 
 		 533 aa  124  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  26.38 
 
 		 535 aa  122  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  30.56 
 
 		 589 aa  120  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  29.13 
 
 		 737 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  28.65 
 
 		 535 aa  117  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  29.83 
 
 		 387 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  28.27 
 
 		 532 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  27.91 
 
 		 604 aa  113  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  25.46 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  28.7 
 
 		 548 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  28.96 
 
 		 693 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  28.41 
 
 		 441 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  29.36 
 
 		 612 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  27.66 
 
 		 567 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  26.33 
 
 		 407 aa  97.1  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  27.17 
 
 		 541 aa  94.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  24.33 
 
 		 597 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  25.37 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  25.6 
 
 		 535 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  24.7 
 
 		 677 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  27.27 
 
 		 658 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  23.26 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  23.31 
 
 		 547 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  24.36 
 
 		 727 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  26.12 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  25.95 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  23.99 
 
 		 636 aa  80.1  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  23.75 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  23.97 
 
 		 631 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  25.27 
 
 		 574 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  24.78 
 
 		 558 aa  73.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  23.96 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  23.09 
 
 		 568 aa  73.6  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  21.47 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  22.73 
 
 		 640 aa  66.6  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  24.72 
 
 		 434 aa  56.6  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  24.26 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  22.86 
 
 		 850 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>