26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1522 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1522  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  391  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0959  DNA-damage-inducible protein D  54.61 
 
 
287 aa  170  9e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1524  DNA-damage-inducible protein D  49.32 
 
 
287 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4242  DNA-damage-inducible protein D  52.45 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0196  DNA-damage-inducible protein D  51.05 
 
 
288 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1711  DNA-damage-inducible protein D  52.42 
 
 
284 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0133  DNA-damage-inducible protein D  52.27 
 
 
281 aa  148  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.277951 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2468  DNA-damage-inducible protein D  50 
 
 
284 aa  147  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0033  DNA-damage-inducible protein D  42.47 
 
 
295 aa  125  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3980  DNA-damage-inducible protein D  42.67 
 
 
274 aa  121  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0985266  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4147  DNA-damage-inducible protein D  42.67 
 
 
274 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920819  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4096  DNA-damage-inducible protein D  42.67 
 
 
274 aa  120  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03454  hypothetical protein  52.53 
 
 
274 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4089  DNA-damage-inducible protein D  49.11 
 
 
285 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5016  DNA-damage-inducible protein D  52.53 
 
 
274 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.760617  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0066  DNA-damage-inducible protein D  52.53 
 
 
274 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.219012  hitchhiker  0.000013205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03502  DNA-damage-inducible protein  52.53 
 
 
278 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.516594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0060  DNA-damage-inducible protein D  39.33 
 
 
274 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0916  DNA-damage-inducible protein D  44.14 
 
 
241 aa  109  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0943  DNA-damage-inducible protein D  47.47 
 
 
281 aa  106  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021495  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0973  DNA-damage-inducible protein D  47.47 
 
 
362 aa  105  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.965716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0074  DNA-damage-inducible protein D  42.98 
 
 
123 aa  101  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.155764 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1121  hypothetical protein  44.33 
 
 
412 aa  89.4  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0766  DNA-damage-inducible protein  33.33 
 
 
215 aa  84.7  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0312128  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1486  DNA-damage-inducible protein  35.2 
 
 
269 aa  74.7  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0161  hypothetical protein  40.74 
 
 
92 aa  51.6  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>