207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1490 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  100 
 
 		 442 aa  901    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  54.98 
 
 		 441 aa  473  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1360  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.937812  normal  0.278157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3365  extracellular solute-binding protein family 1  33.42 
 
 		 455 aa  186  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.079846  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  30.96 
 
 		 452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  29.4 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  27.58 
 
 		 466 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.04 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4612  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.74 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 		 431 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 444 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 433 aa  94.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 431 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  23.63 
 
 		 461 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 425 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  23.85 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 		 468 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  23.8 
 
 		 487 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  20.81 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.15 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  21.27 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  22.32 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.79 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  22.32 
 
 		 422 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  20.43 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2834  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0227  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.998322  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  21.88 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  21.5 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.26 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2855  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830086 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  20.61 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 417 aa  56.6  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.41 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.9 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2252  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00844632  hitchhiker  0.0063434 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.68 
 
 		 450 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  20.25 
 
 		 439 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 434 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  22.12 
 
 		 493 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 		 417 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.96 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  22.72 
 
 		 427 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  22.75 
 
 		 424 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 464 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 427 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 444 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26610  carbohydrate-binding protein  23.03 
 
 		 425 aa  53.5  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 446 aa  53.5  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 462 aa  53.1  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 444 aa  53.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  22.42 
 
 		 420 aa  53.1  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  20.43 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1292  glucose ABC transporter, periplasmic glucose-binding protein, putative  27.06 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.927491  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0219  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.61 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000685496  hitchhiker  0.000000202467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.26 
 
 		 485 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.84 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1885  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>