More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1442 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
323 aa  662    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  70.19 
 
 
323 aa  451  1.0000000000000001e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2552  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.9 
 
 
312 aa  325  7e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000741999  normal  0.352702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.55 
 
 
301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.3 
 
 
410 aa  316  4e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  50.97 
 
 
315 aa  307  1.0000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38000  chromosome segregation ATPase  55.05 
 
 
305 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.39 
 
 
339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4166  chromosome segregation ATPase  53.66 
 
 
333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.31 
 
 
355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.44 
 
 
392 aa  298  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3720  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.62 
 
 
416 aa  297  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000821515  hitchhiker  0.000233932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.96 
 
 
303 aa  296  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4218  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.39 
 
 
452 aa  295  8e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.32 
 
 
462 aa  294  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013089 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  55.48 
 
 
341 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  54.85 
 
 
330 aa  292  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.4 
 
 
346 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.49 
 
 
433 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  57.2 
 
 
361 aa  290  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  52.96 
 
 
308 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.49 
 
 
437 aa  288  6e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.79 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.98 
 
 
358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.37 
 
 
314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  53.41 
 
 
345 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4237  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.09 
 
 
304 aa  278  6e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31920  chromosome segregation ATPase  49.47 
 
 
293 aa  279  6e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  55.21 
 
 
370 aa  276  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.99 
 
 
336 aa  276  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.91 
 
 
470 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  52.83 
 
 
335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  52.83 
 
 
335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  52.83 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2155  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.76 
 
 
312 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.426789  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.01 
 
 
315 aa  269  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.05 
 
 
318 aa  268  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  50.55 
 
 
347 aa  263  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  52.38 
 
 
253 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  50.99 
 
 
257 aa  248  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  49.02 
 
 
257 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  47.08 
 
 
348 aa  244  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.1 
 
 
256 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  47.1 
 
 
258 aa  242  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  51.2 
 
 
256 aa  243  5e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.19 
 
 
253 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.84 
 
 
294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  48.22 
 
 
253 aa  239  4e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.24 
 
 
254 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.26 
 
 
257 aa  236  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.9 
 
 
295 aa  236  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.3 
 
 
257 aa  236  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.41 
 
 
253 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  47.06 
 
 
257 aa  236  6e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  47.06 
 
 
257 aa  236  6e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.12 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  47.64 
 
 
259 aa  233  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.47 
 
 
269 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.02 
 
 
253 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.88 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.48 
 
 
273 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.24 
 
 
255 aa  231  9e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  46.88 
 
 
260 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  45.6 
 
 
249 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.92 
 
 
262 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.7 
 
 
255 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  46.4 
 
 
257 aa  229  4e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.04 
 
 
266 aa  229  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  44.65 
 
 
270 aa  229  6e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.75 
 
 
266 aa  229  7e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.22 
 
 
253 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  44.53 
 
 
253 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.87 
 
 
284 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  43.68 
 
 
264 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.64 
 
 
268 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.56 
 
 
256 aa  225  6e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.22 
 
 
253 aa  225  7e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  46.83 
 
 
253 aa  225  9e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.64 
 
 
257 aa  225  9e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.91 
 
 
273 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.49 
 
 
270 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.98 
 
 
284 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  44.53 
 
 
294 aa  223  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.87 
 
 
271 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.91 
 
 
262 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  43.36 
 
 
258 aa  223  4.9999999999999996e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  45.53 
 
 
276 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.36 
 
 
270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  44.4 
 
 
283 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.25 
 
 
257 aa  222  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.06 
 
 
270 aa  222  8e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  45.49 
 
 
259 aa  222  8e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.73 
 
 
270 aa  221  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.45 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.25 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.31 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  44.09 
 
 
258 aa  220  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  43.46 
 
 
265 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  45.28 
 
 
254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>