More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1436 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0045  chromosomal replication initiator protein DnaA  68.53 
 
 
539 aa  739    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
500 aa  1037    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.75 
 
 
468 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.22 
 
 
476 aa  397  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000240109  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.65 
 
 
473 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000284064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.93 
 
 
474 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.98 
 
 
489 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.38 
 
 
490 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.8 
 
 
534 aa  385  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.9 
 
 
506 aa  381  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.85 
 
 
515 aa  378  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  51.28 
 
 
597 aa  372  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000000278732  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  41.88 
 
 
494 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.51 
 
 
509 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.83 
 
 
480 aa  366  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44 
 
 
528 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  43.22 
 
 
495 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  43.22 
 
 
495 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  43.22 
 
 
495 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  41.46 
 
 
492 aa  363  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10001  chromosomal replication initiation protein  44.65 
 
 
507 aa  363  4e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.62 
 
 
527 aa  363  6e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  41.34 
 
 
450 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  56.36 
 
 
582 aa  359  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000523076  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0001  chromosomal replication initiation protein  50.91 
 
 
577 aa  359  8e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  49.72 
 
 
440 aa  358  9e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.57 
 
 
721 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.64 
 
 
587 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.67 
 
 
562 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000690317  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.12 
 
 
518 aa  356  5.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.7384  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.35 
 
 
591 aa  355  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.64 
 
 
490 aa  352  7e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428353  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  55.85 
 
 
615 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  0.000000000479277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  41.32 
 
 
450 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.34 
 
 
454 aa  351  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.38 
 
 
453 aa  352  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.76 
 
 
570 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.85 
 
 
652 aa  350  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.00000505913  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0001  chromosomal replication initiation protein  52.62 
 
 
557 aa  350  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  50.58 
 
 
457 aa  349  5e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  50.58 
 
 
457 aa  349  5e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  40.99 
 
 
446 aa  348  9e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  40.99 
 
 
446 aa  348  9e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  40.99 
 
 
446 aa  348  9e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  40.99 
 
 
446 aa  348  9e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  40.99 
 
 
446 aa  348  9e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.07 
 
 
444 aa  348  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.44 
 
 
565 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.21 
 
 
450 aa  348  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  40.17 
 
 
446 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  40.17 
 
 
446 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  40.41 
 
 
446 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  41.73 
 
 
472 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  40.17 
 
 
446 aa  346  6e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  45.14 
 
 
446 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.72 
 
 
458 aa  344  2e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.58 
 
 
443 aa  343  5e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.88 
 
 
527 aa  343  5.999999999999999e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.26 
 
 
463 aa  343  5.999999999999999e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  39.96 
 
 
446 aa  342  7e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.35 
 
 
566 aa  342  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  47.68 
 
 
481 aa  339  5e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.09 
 
 
446 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  50.43 
 
 
442 aa  336  7e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  51.03 
 
 
441 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  44.77 
 
 
478 aa  335  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  41.41 
 
 
443 aa  334  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  48.4 
 
 
480 aa  333  6e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.7 
 
 
449 aa  332  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.27 
 
 
456 aa  331  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.48 
 
 
439 aa  330  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  38.52 
 
 
492 aa  329  7e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.68 
 
 
584 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  48.24 
 
 
443 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.86 
 
 
454 aa  326  5e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  49.41 
 
 
451 aa  325  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  39.71 
 
 
470 aa  322  7e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.41 
 
 
453 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  38.89 
 
 
492 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.5 
 
 
439 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  47.29 
 
 
436 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  46.17 
 
 
453 aa  319  6e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  46.17 
 
 
453 aa  319  6e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  43.05 
 
 
460 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  43.05 
 
 
460 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  43.05 
 
 
460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  43.05 
 
 
460 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  42.93 
 
 
461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  43.12 
 
 
494 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  37.32 
 
 
482 aa  312  7.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  46.22 
 
 
440 aa  312  7.999999999999999e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  44.94 
 
 
524 aa  312  9e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0001  chromosomal replication initiator protein, DnaA  47.87 
 
 
449 aa  312  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  43.2 
 
 
461 aa  311  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.46 
 
 
447 aa  311  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  37.53 
 
 
461 aa  311  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  42.49 
 
 
465 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  50 
 
 
445 aa  311  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  37.21 
 
 
462 aa  311  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  47.52 
 
 
478 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>