More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1432 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0006  DNA gyrase subunit B  66.37 
 
 
685 aa  863    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  56.33 
 
 
645 aa  716    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0007  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  60.99 
 
 
647 aa  781    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  61.75 
 
 
647 aa  780    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  50.08 
 
 
636 aa  640    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  52.89 
 
 
644 aa  656    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  66.67 
 
 
695 aa  880    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0006  DNA gyrase, B subunit  68.88 
 
 
698 aa  869    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  53.73 
 
 
650 aa  651    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  53.11 
 
 
643 aa  673    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  52.85 
 
 
633 aa  662    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0006  DNA gyrase, B subunit  59.58 
 
 
645 aa  760    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0161215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  55.62 
 
 
714 aa  776    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  60.78 
 
 
661 aa  773    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  54.95 
 
 
648 aa  693    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0006  DNA gyrase subunit B  58.86 
 
 
652 aa  728    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  54.02 
 
 
633 aa  650    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  50.98 
 
 
650 aa  640    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00060  DNA gyrase subunit B  61.38 
 
 
701 aa  825    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  51.44 
 
 
637 aa  658    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  59.94 
 
 
661 aa  801    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0005  DNA gyrase, B subunit  59.05 
 
 
685 aa  795    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  100 
 
 
696 aa  1435    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  66.31 
 
 
686 aa  913    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  51.97 
 
 
642 aa  640    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00050  DNA gyrase subunit B  64.6 
 
 
720 aa  860    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  54.55 
 
 
645 aa  660    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  60.39 
 
 
657 aa  798    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  58.86 
 
 
648 aa  756    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  57.69 
 
 
675 aa  774    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0006  DNA gyrase B subunit  58.46 
 
 
656 aa  761    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0006  DNA gyrase subunit B  58.41 
 
 
679 aa  728    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.216936  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  48.41 
 
 
675 aa  648    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0010  DNA gyrase, B subunit  55.93 
 
 
680 aa  724    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  56.05 
 
 
675 aa  761    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  52.5 
 
 
649 aa  683    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  52.96 
 
 
632 aa  662    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  53.25 
 
 
641 aa  654    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0007  DNA gyrase, B subunit  56.57 
 
 
670 aa  725    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0005  DNA gyrase, B subunit  52.99 
 
 
647 aa  652    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  55.39 
 
 
648 aa  712    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  57.69 
 
 
675 aa  774    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  53.71 
 
 
644 aa  697    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  49.55 
 
 
637 aa  655    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  54.38 
 
 
638 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  54.53 
 
 
638 aa  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0006  DNA gyrase, B subunit  61.98 
 
 
686 aa  785    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629788 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0041  DNA gyrase, B subunit  89.54 
 
 
691 aa  1237    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  62.24 
 
 
649 aa  810    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  57.81 
 
 
719 aa  743    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00100  DNA gyrase subunit B  62.95 
 
 
711 aa  809    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.11 
 
 
633 aa  681    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  55.54 
 
 
651 aa  673    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  52.85 
 
 
640 aa  643    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  51.86 
 
 
647 aa  665    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  50.98 
 
 
640 aa  667    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  51.51 
 
 
635 aa  650    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0009  DNA gyrase, B subunit  56.76 
 
 
688 aa  761    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  56.38 
 
 
650 aa  671    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  66.07 
 
 
696 aa  870    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  53.32 
 
 
633 aa  654    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  52.63 
 
 
628 aa  674    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  53.25 
 
 
641 aa  664    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  60.03 
 
 
666 aa  803    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  59.64 
 
 
654 aa  786    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0006  DNA gyrase, B subunit  67.36 
 
 
681 aa  894    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00060  DNA gyrase subunit B  69.18 
 
 
683 aa  911    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0006  DNA gyrase subunit B  57.54 
 
 
711 aa  703    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685499  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  57.69 
 
 
675 aa  774    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  56.78 
 
 
675 aa  761    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  53.26 
 
 
644 aa  670    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  50.45 
 
 
637 aa  633  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  53.74 
 
 
643 aa  628  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  49.11 
 
 
644 aa  629  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  50.68 
 
 
634 aa  629  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  51.07 
 
 
649 aa  629  1e-179  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  53.06 
 
 
638 aa  628  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  54 
 
 
640 aa  628  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  51.96 
 
 
642 aa  625  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  53.22 
 
 
640 aa  628  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  49.48 
 
 
659 aa  626  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  53.78 
 
 
635 aa  628  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  53.19 
 
 
640 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  53.53 
 
 
640 aa  626  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  52.92 
 
 
640 aa  624  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  52.92 
 
 
640 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  52.92 
 
 
640 aa  624  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  49.32 
 
 
636 aa  622  1e-177  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  52.92 
 
 
640 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  52.92 
 
 
640 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  52.92 
 
 
640 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  49.48 
 
 
642 aa  619  1e-176  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  53.07 
 
 
640 aa  619  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  49.7 
 
 
645 aa  620  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  53.07 
 
 
640 aa  620  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  48.59 
 
 
654 aa  615  1e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  47.39 
 
 
665 aa  615  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1453  DNA gyrase, B subunit  50.15 
 
 
658 aa  616  1e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  49.77 
 
 
642 aa  617  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  50.07 
 
 
652 aa  615  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>