115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1397 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  100 
 
 		 637 aa  1304    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  64.01 
 
 		 573 aa  520  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  46.99 
 
 		 458 aa  294  3e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  43.26 
 
 		 415 aa  289  1e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  44.85 
 
 		 455 aa  289  1e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  45.61 
 
 		 451 aa  279  1e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  40.66 
 
 		 422 aa  229  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  39.58 
 
 		 422 aa  208  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  39.06 
 
 		 440 aa  208  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  39.51 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  41.05 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  30.41 
 
 		 418 aa  100  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  25.55 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  30.52 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  29.41 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  29.41 
 
 		 266 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  29.41 
 
 		 266 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  33.53 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  33.53 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  23.57 
 
 		 164 aa  60.5  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  24.29 
 
 		 164 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  28.04 
 
 		 251 aa  60.1  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  24.29 
 
 		 164 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  27.16 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  27.51 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2893  hypothetical protein  26.52 
 
 		 269 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.135065  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  25.77 
 
 		 426 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  35.78 
 
 		 154 aa  56.6  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  22.46 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  28 
 
 		 511 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  36.56 
 
 		 157 aa  55.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  27.33 
 
 		 164 aa  54.7  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  25.15 
 
 		 448 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  24.09 
 
 		 163 aa  54.3  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  28.74 
 
 		 277 aa  54.3  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  29.09 
 
 		 258 aa  53.9  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  28.74 
 
 		 277 aa  53.9  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  28.74 
 
 		 256 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  28.74 
 
 		 256 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  26.67 
 
 		 164 aa  53.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  28.74 
 
 		 256 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  28.74 
 
 		 277 aa  53.5  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  28.74 
 
 		 256 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  26.55 
 
 		 267 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2542  hypothetical protein  25.87 
 
 		 267 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61782  predicted protein  25 
 
 		 696 aa  52.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  28.74 
 
 		 274 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  27.89 
 
 		 174 aa  52.8  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  31.37 
 
 		 159 aa  52.4  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  28.74 
 
 		 274 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2927  hypothetical protein  29.34 
 
 		 267 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  31.72 
 
 		 266 aa  51.6  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  35.19 
 
 		 161 aa  51.6  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  25 
 
 		 406 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  27.61 
 
 		 253 aa  50.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  32.33 
 
 		 153 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  26.35 
 
 		 314 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03479  DUF1212 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07620)  25.08 
 
 		 792 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0454304 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  28.12 
 
 		 268 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  32.35 
 
 		 156 aa  49.3  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  30.7 
 
 		 253 aa  49.7  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  26.35 
 
 		 314 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  26.35 
 
 		 314 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  26.35 
 
 		 314 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  26.21 
 
 		 193 aa  49.3  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  25 
 
 		 406 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  24.46 
 
 		 262 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  25 
 
 		 406 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  23.89 
 
 		 303 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  25 
 
 		 406 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  23.08 
 
 		 406 aa  48.5  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2003  hypothetical protein  26.52 
 
 		 150 aa  48.5  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477013 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  29.69 
 
 		 253 aa  48.1  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1613  hypothetical protein  23.31 
 
 		 421 aa  47.4  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  30.88 
 
 		 258 aa  47.4  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3450  hypothetical protein  31.18 
 
 		 156 aa  47.4  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3579  hypothetical protein  31.18 
 
 		 156 aa  47.4  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  32.35 
 
 		 157 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  30.14 
 
 		 262 aa  46.6  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  29.41 
 
 		 253 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  27.66 
 
 		 156 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  25.97 
 
 		 253 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  20.14 
 
 		 143 aa  47  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  30.11 
 
 		 156 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  27.61 
 
 		 253 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  27.61 
 
 		 253 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  46.2  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  28.76 
 
 		 261 aa  45.4  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  32.26 
 
 		 156 aa  45.8  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  23.51 
 
 		 406 aa  45.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  27.61 
 
 		 253 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  27.61 
 
 		 253 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0598  hypothetical protein  31.18 
 
 		 156 aa  45.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.762355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1850  hypothetical protein  27.63 
 
 		 540 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  23.57 
 
 		 256 aa  45.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  31.18 
 
 		 157 aa  45.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2857  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  45.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00177194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4595  hypothetical protein  32.26 
 
 		 157 aa  45.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.2901e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  24.71 
 
 		 261 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4956  hypothetical protein  32.26 
 
 		 157 aa  44.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000176607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>