More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1379 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  64.34 
 
 
554 aa  699    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  100 
 
 
564 aa  1151    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  39.02 
 
 
500 aa  314  2.9999999999999996e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  55.32 
 
 
507 aa  270  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  49.62 
 
 
466 aa  264  4e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  33.98 
 
 
558 aa  255  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  52.76 
 
 
479 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  34.79 
 
 
474 aa  238  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  54.22 
 
 
511 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  41.58 
 
 
505 aa  232  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.1 
 
 
482 aa  230  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  48.43 
 
 
463 aa  226  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  45.42 
 
 
567 aa  221  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.4 
 
 
438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  44.15 
 
 
472 aa  213  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  46.46 
 
 
462 aa  211  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  44.92 
 
 
478 aa  209  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  43.98 
 
 
421 aa  206  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  39.32 
 
 
477 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  42.42 
 
 
478 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  38.56 
 
 
441 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  45.37 
 
 
514 aa  203  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  40.14 
 
 
449 aa  200  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  42.8 
 
 
426 aa  200  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  44.54 
 
 
463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  34.03 
 
 
519 aa  197  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.49 
 
 
516 aa  195  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  44.49 
 
 
491 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.49 
 
 
491 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.49 
 
 
517 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.49 
 
 
491 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  43.53 
 
 
247 aa  193  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  43.89 
 
 
469 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  43.75 
 
 
467 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  43.61 
 
 
474 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  43.04 
 
 
519 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  39.27 
 
 
265 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  42.55 
 
 
571 aa  185  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  43.53 
 
 
395 aa  185  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.85 
 
 
241 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  43.21 
 
 
239 aa  181  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  44.4 
 
 
452 aa  178  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  39.92 
 
 
404 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  42.11 
 
 
241 aa  173  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.56 
 
 
239 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  41.3 
 
 
425 aa  172  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  43.59 
 
 
364 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  41.18 
 
 
253 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.97 
 
 
247 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  41.3 
 
 
394 aa  162  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0035  protein serine/threonine phosphatase  41.55 
 
 
687 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  40.54 
 
 
259 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  37.92 
 
 
323 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  37.02 
 
 
238 aa  150  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  38.46 
 
 
319 aa  149  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.86 
 
 
237 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  37.55 
 
 
255 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  37.12 
 
 
597 aa  147  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.25 
 
 
280 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  37.13 
 
 
325 aa  145  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  39.22 
 
 
416 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  35.32 
 
 
250 aa  144  5e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  37.19 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0785  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.87 
 
 
247 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  35.69 
 
 
276 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  36.75 
 
 
236 aa  141  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  35.38 
 
 
574 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  33.46 
 
 
386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.11 
 
 
611 aa  141  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  33.47 
 
 
247 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  33.47 
 
 
247 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  37.1 
 
 
361 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  34.85 
 
 
258 aa  139  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0489  protein serine/threonine phosphatase  36.73 
 
 
285 aa  137  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.650161  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  36.32 
 
 
538 aa  137  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  39.17 
 
 
381 aa  136  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  34.85 
 
 
250 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  39.06 
 
 
422 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  37.6 
 
 
259 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  35.44 
 
 
241 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  36.64 
 
 
274 aa  135  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  36.68 
 
 
389 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  33.62 
 
 
239 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.83 
 
 
238 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  33.88 
 
 
254 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.86 
 
 
271 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  37.19 
 
 
259 aa  133  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  33.86 
 
 
271 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  34.76 
 
 
243 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  33.88 
 
 
245 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  32.65 
 
 
250 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  36.63 
 
 
348 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  33.74 
 
 
250 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  33.74 
 
 
250 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  33.47 
 
 
250 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  33.88 
 
 
250 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  33.74 
 
 
250 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  33.88 
 
 
250 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  33.05 
 
 
249 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  32.77 
 
 
239 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>