278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1359 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1359  site-specific DNA methylase  100 
 
 
423 aa  877  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  3.54899e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  72.01 
 
 
424 aa  628  1e-179  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  2.01074e-09 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  48.12 
 
 
435 aa  358  1e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  44.52 
 
 
407 aa  330  4e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  1.73246e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0566  DNA-cytosine methyltransferase  42.28 
 
 
449 aa  299  8e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.76321  normal  0.105811 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  40.62 
 
 
404 aa  282  1e-74  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  35.57 
 
 
413 aa  112  1e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.33 
 
 
328 aa  107  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  31.68 
 
 
324 aa  104  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  34.5 
 
 
323 aa  103  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  31.28 
 
 
318 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  32.84 
 
 
319 aa  101  2e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  30.1 
 
 
320 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  33.83 
 
 
315 aa  100  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 
416 aa  99.8  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  9.39229e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  27.6 
 
 
329 aa  99.8  9e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  32.16 
 
 
305 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.85 
 
 
451 aa  98.2  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  30.81 
 
 
320 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  31.82 
 
 
437 aa  97.1  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 
727 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  36.04 
 
 
483 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
336 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  28.87 
 
 
338 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  31.58 
 
 
657 aa  93.6  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  32.99 
 
 
490 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  27.46 
 
 
331 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  31.82 
 
 
438 aa  91.7  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  26.72 
 
 
406 aa  92  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  29.9 
 
 
350 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  1.50039e-09 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  34.33 
 
 
313 aa  90.9  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  30.93 
 
 
311 aa  90.5  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  26.94 
 
 
327 aa  90.1  7e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  30.62 
 
 
350 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  31.31 
 
 
348 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  1.1708e-08 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  28.5 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  32.84 
 
 
427 aa  89  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  30.35 
 
 
428 aa  87  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  29.69 
 
 
368 aa  87  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  31.58 
 
 
460 aa  85.9  1e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  31.58 
 
 
460 aa  85.9  1e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  30.41 
 
 
419 aa  85.9  1e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  2.23127e-07 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  25.55 
 
 
406 aa  85.1  2e-15  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  29.17 
 
 
308 aa  85.5  2e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  31.12 
 
 
417 aa  85.1  2e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  29.72 
 
 
417 aa  85.5  2e-15  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
416 aa  85.1  2e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  32.84 
 
 
239 aa  84.3  3e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  25.36 
 
 
417 aa  83.6  6e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  29.67 
 
 
350 aa  83.2  8e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  29.44 
 
 
425 aa  82.8  1e-14  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  36.45 
 
 
383 aa  82.8  1e-14  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  29.21 
 
 
426 aa  82  2e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  32.35 
 
 
390 aa  82  2e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.25 
 
 
283 aa  81.3  3e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  32.29 
 
 
328 aa  81.3  3e-14  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.7 
 
 
418 aa  80.9  4e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  31.19 
 
 
436 aa  80.5  6e-14  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 
335 aa  80.1  7e-14  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  27.75 
 
 
313 aa  79.3  1e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 
334 aa  79  1e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  31.12 
 
 
424 aa  79.3  1e-13  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  2.66884e-09  hitchhiker  1.86187e-12 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  26.57 
 
 
345 aa  79.3  1e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  30.26 
 
 
415 aa  78.6  2e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  31.37 
 
 
390 aa  77.8  4e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.63 
 
 
357 aa  75.1  2e-12  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.73164e-05 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  28.93 
 
 
335 aa  75.5  2e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  2.69653e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  32.5 
 
 
370 aa  74.7  3e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  6.74254e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  27.73 
 
 
471 aa  74.3  4e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  30.88 
 
 
440 aa  73.9  4e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  28.44 
 
 
373 aa  73.9  5e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  29.8 
 
 
423 aa  73.2  8e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  25.82 
 
 
491 aa  73.2  8e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
487 aa  73.2  9e-12  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  26.58 
 
 
398 aa  72.8  1e-11  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  26.9 
 
 
329 aa  72.8  1e-11  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  1.9493e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  28.77 
 
 
447 aa  72.4  1e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  29.47 
 
 
456 aa  71.6  2e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.94 
 
 
395 aa  71.6  2e-11  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  28.1 
 
 
420 aa  72.4  2e-11  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  29.47 
 
 
456 aa  71.6  2e-11  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.08 
 
 
323 aa  72  2e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  29.29 
 
 
423 aa  71.6  3e-11  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  31.19 
 
 
310 aa  71.6  3e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  35 
 
 
352 aa  71.2  3e-11  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  26.48 
 
 
476 aa  70.9  4e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  26.48 
 
 
476 aa  70.9  4e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  26.61 
 
 
476 aa  70.9  4e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  26.48 
 
 
476 aa  70.9  4e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  26.48 
 
 
476 aa  70.9  4e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  26.32 
 
 
474 aa  70.1  7e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  26.92 
 
 
467 aa  70.1  7e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  25.77 
 
 
389 aa  70.1  8e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  2.03506e-05  hitchhiker  4.0976e-05 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  26.15 
 
 
472 aa  69.7  9e-11  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  26.15 
 
 
472 aa  69.3  1e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  30.15 
 
 
380 aa  69.3  1e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  26.15 
 
 
472 aa  69.3  1e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  26.15 
 
 
472 aa  69.3  1e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  29.53 
 
 
379 aa  68.9  1e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  26.15 
 
 
472 aa  68.9  1e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>