226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1355 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  100 
 
 
285 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  40.84 
 
 
314 aa  228  7e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  44.35 
 
 
274 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  45.67 
 
 
268 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  45.02 
 
 
262 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  45.05 
 
 
366 aa  162  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  45.54 
 
 
225 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  40.36 
 
 
249 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  48.29 
 
 
239 aa  159  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  42.25 
 
 
250 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  45.33 
 
 
246 aa  155  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  36.33 
 
 
254 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  43 
 
 
243 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  42.51 
 
 
246 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  36.6 
 
 
243 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  41.4 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  40.38 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  39.22 
 
 
276 aa  142  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  36.41 
 
 
273 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  41.9 
 
 
224 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  36.27 
 
 
305 aa  138  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  41.15 
 
 
225 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  37.95 
 
 
270 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  38.03 
 
 
225 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  37.05 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  37.39 
 
 
225 aa  108  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  33.65 
 
 
243 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  40 
 
 
224 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  33.65 
 
 
250 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  33.65 
 
 
242 aa  102  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  34.67 
 
 
270 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  34.67 
 
 
270 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  34.22 
 
 
270 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  39.17 
 
 
216 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  41 
 
 
217 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  36.21 
 
 
239 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  36.28 
 
 
229 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  35.55 
 
 
218 aa  96.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  31.75 
 
 
247 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  31.75 
 
 
247 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  31.75 
 
 
247 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  33.17 
 
 
218 aa  95.5  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  37.69 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  39.29 
 
 
216 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  38 
 
 
219 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  37.19 
 
 
219 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  33.95 
 
 
232 aa  91.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  31.63 
 
 
235 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  36.9 
 
 
213 aa  89.7  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  35.35 
 
 
217 aa  89.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  32.29 
 
 
195 aa  89.4  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  36.04 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  32.47 
 
 
192 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  35.75 
 
 
215 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  31.12 
 
 
195 aa  85.9  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  35.83 
 
 
200 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  34.27 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  30.7 
 
 
214 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  33.01 
 
 
208 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46556  predicted protein  29.27 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000802712  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  35.2 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  27.97 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  28.44 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  33.71 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  32.33 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  28.44 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  32.39 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  27.52 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  27.52 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  27.52 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  27.52 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  26.43 
 
 
215 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  27.06 
 
 
215 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  28.44 
 
 
215 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  26.61 
 
 
215 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  26.61 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  32.37 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  29.52 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0520  hemolysin like protein  34 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  32.58 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  27.06 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  30.6 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  31.79 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  29.08 
 
 
216 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  33.53 
 
 
215 aa  67  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  34.27 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  30.6 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  30.68 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  30.68 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  30.68 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  30.68 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  30.68 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  30.64 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  26.21 
 
 
208 aa  63.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3552  hemolysin III family channel protein  30.23 
 
 
214 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  33.33 
 
 
205 aa  63.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  28.79 
 
 
216 aa  62.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  29.48 
 
 
219 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  29.48 
 
 
219 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>