More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1309 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1309  Xanthine/uracil permease  100 
 
 
450 aa  870    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00197381  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0933  xanthine/uracil permease  53.52 
 
 
428 aa  432  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  31.07 
 
 
442 aa  190  5e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  30.95 
 
 
452 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1511  uracil-xanthine permease  33.33 
 
 
413 aa  178  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0982636  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  30.71 
 
 
452 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0068  xanthine permease  32.37 
 
 
422 aa  176  6e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0447  uracil-xanthine permease  31.64 
 
 
422 aa  176  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218584  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0436  uracil-xanthine permease  31.64 
 
 
422 aa  176  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  34.44 
 
 
461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0206  uracil-xanthine permease  32.21 
 
 
413 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  29.98 
 
 
452 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0701  xanthine/uracil permease family protein  32.52 
 
 
435 aa  169  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0895  uracil-xanthine permease  31.69 
 
 
413 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1705  uracil-xanthine permease  31.43 
 
 
413 aa  167  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.297144  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  27.71 
 
 
451 aa  167  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  32.23 
 
 
466 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1085  xanthine permease  31.17 
 
 
424 aa  159  7e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2514  xanthine/uracil/vitamin C permease  30.81 
 
 
457 aa  159  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317709  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  30.66 
 
 
449 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  30.52 
 
 
470 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  32.55 
 
 
501 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1828  uracil-xanthine permease  29.67 
 
 
442 aa  154  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1266  xanthine/uracil permease  31.22 
 
 
427 aa  152  8e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144889  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  31.58 
 
 
458 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0234  uracil-xanthine permease  30.79 
 
 
487 aa  152  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.72868  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  30.06 
 
 
459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000668836  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0536  xanthine/uracil permease  28.79 
 
 
448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  31.99 
 
 
505 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  30.2 
 
 
566 aa  146  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  31.27 
 
 
497 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0629  Xanthine/uracil permease  31.74 
 
 
454 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0040794  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  29.79 
 
 
455 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  32.14 
 
 
487 aa  144  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  29.84 
 
 
482 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  29.79 
 
 
455 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  28.5 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  29.14 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  29.59 
 
 
458 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  29.66 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  31.1 
 
 
505 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  29.88 
 
 
465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  31.1 
 
 
505 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  30.86 
 
 
505 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  31.18 
 
 
493 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  29.05 
 
 
469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  29.93 
 
 
450 aa  140  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  31.04 
 
 
503 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  28.24 
 
 
440 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  28.24 
 
 
440 aa  140  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  28.24 
 
 
440 aa  140  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0967  uracil-xanthine permease  29.34 
 
 
496 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  30.09 
 
 
463 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  28.01 
 
 
440 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  29.45 
 
 
494 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  30.51 
 
 
435 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  28.24 
 
 
440 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  28.01 
 
 
440 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  28.24 
 
 
440 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  28.24 
 
 
440 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  28.24 
 
 
440 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  28.24 
 
 
440 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  28.24 
 
 
440 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  29.77 
 
 
463 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  31.73 
 
 
500 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  29.27 
 
 
452 aa  137  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  29.41 
 
 
647 aa  137  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  31.12 
 
 
506 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  28.71 
 
 
500 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3606  xanthine permease  27.94 
 
 
457 aa  136  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3080  xanthine/uracil permease  30.45 
 
 
449 aa  136  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230022  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  32.74 
 
 
459 aa  136  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  28.24 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  27.78 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  28.01 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  31.12 
 
 
509 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  27.01 
 
 
462 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  28.44 
 
 
461 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3209  xanthine permease  31.33 
 
 
501 aa  133  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  28.61 
 
 
825 aa  133  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  29.65 
 
 
438 aa  133  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3433  xanthine/uracil permease  27.83 
 
 
451 aa  133  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  28.44 
 
 
472 aa  133  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  29.7 
 
 
445 aa  133  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  25.75 
 
 
446 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  30.52 
 
 
485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  28.05 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  28.44 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  28.64 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  28.44 
 
 
461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0633  xanthine/uracil transporter  27.37 
 
 
457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757735  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  29.2 
 
 
457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  29.74 
 
 
458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1425  xanthine permease  29.49 
 
 
449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000466476  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  27.59 
 
 
482 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  27.59 
 
 
482 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  27.59 
 
 
482 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  27.59 
 
 
482 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  27.36 
 
 
525 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  27.59 
 
 
482 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>