More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1301 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  100 
 
 		 441 aa  900    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  33.64 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 		 424 aa  120  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  30.15 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  29.9 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.57 
 
 		 419 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  28.27 
 
 		 441 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.2 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.64 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.64 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 427 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 458 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  31.11 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 419 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 429 aa  97.1  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  28.43 
 
 		 441 aa  96.7  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 439 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  21.9 
 
 		 439 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 421 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 446 aa  94.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 		 435 aa  93.6  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  30.47 
 
 		 419 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 449 aa  93.2  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.02 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 		 419 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 451 aa  90.1  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  29.84 
 
 		 434 aa  90.1  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 461 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.61 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 422 aa  88.2  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 		 432 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 		 429 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 		 441 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 412 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 419 aa  87  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 412 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  22.17 
 
 		 417 aa  86.7  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  30.33 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.12 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  26.13 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  27.9 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.8 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.95 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  24.54 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  29.45 
 
 		 493 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.38 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.82 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  22.03 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  21.98 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  30.15 
 
 		 430 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1269  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.53 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 		 434 aa  73.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>