More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1290 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  410  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  40.88 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0384  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 225 aa  104  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  31.32 
 
 		 223 aa  91.3  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 227 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  25.41 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  37.84 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  30.21 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  33.85 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 311 aa  52  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 125 aa  52  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
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NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
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NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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