More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1235 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  100 
 
 
112 aa  221  4e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  174  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  169  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  167  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  69.37 
 
 
113 aa  160  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  152  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  62.5 
 
 
112 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1163  nitrogen regulatory protein P-II  70.27 
 
 
113 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334919  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  149  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  149  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
117 aa  149  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  61.61 
 
 
112 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 
112 aa  148  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  146  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3148  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000232085  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3268  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
112 aa  144  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0681608  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2231  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 
112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000261063 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1394  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00884752  decreased coverage  0.00366325 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.93 
 
 
112 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  142  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  142  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  142  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  57.14 
 
 
112 aa  141  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3426  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  141  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000243696  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  141  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  140  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  140  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  140  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  141  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  140  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  140  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  140  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  140  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  140  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  55.36 
 
 
112 aa  140  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.46 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.14 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
114 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3772  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  138  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  138  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  58.93 
 
 
112 aa  138  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  58.93 
 
 
112 aa  138  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  57.14 
 
 
112 aa  138  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  138  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1710  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.619022  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.93 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
115 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  137  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  137  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>