More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1218 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  61.93 
 
 		 193 aa  240  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  78.95 
 
 		 179 aa  215  4e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  71.43 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  68.6 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  67.23 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  62.1 
 
 		 159 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  66.39 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  50 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  66.39 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  69.75 
 
 		 189 aa  174  6e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  61.16 
 
 		 170 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  61.9 
 
 		 166 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  64.71 
 
 		 177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  65.55 
 
 		 193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  65.55 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  61.16 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  62.18 
 
 		 192 aa  171  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  62.18 
 
 		 193 aa  171  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  64.71 
 
 		 175 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  62.18 
 
 		 164 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  60.63 
 
 		 300 aa  169  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  61.98 
 
 		 168 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  62.18 
 
 		 156 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  61.34 
 
 		 172 aa  167  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  59.66 
 
 		 165 aa  167  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  61.34 
 
 		 172 aa  167  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  61.34 
 
 		 172 aa  167  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  60.33 
 
 		 188 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  59.66 
 
 		 163 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  56.2 
 
 		 167 aa  161  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  56.2 
 
 		 169 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  49.22 
 
 		 178 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  47.25 
 
 		 170 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  55.56 
 
 		 171 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  56.67 
 
 		 153 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  59.09 
 
 		 171 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  56.3 
 
 		 195 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  55.08 
 
 		 191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  55.08 
 
 		 170 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  58.82 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  56.41 
 
 		 179 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  55.46 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  45.38 
 
 		 167 aa  118  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  40.52 
 
 		 148 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  41.8 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  46.02 
 
 		 148 aa  105  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  46.9 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  38.52 
 
 		 305 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  35.96 
 
 		 174 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  40 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  38.51 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  38 
 
 		 154 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  44.55 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  33.05 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  36.21 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  36.21 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  33.16 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 146 aa  74.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  35.9 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0163  single-strand binding protein  40.59 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000810976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  35.9 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  40 
 
 		 137 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  42.27 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0108  single-strand binding protein  42.27 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000326316  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  34.58 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0159  single-strand binding protein  40.59 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000321111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  41.24 
 
 		 157 aa  72  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 191 aa  72  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0115  single-strand binding protein  40.21 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  41.24 
 
 		 152 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  40 
 
 		 142 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  30.1 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  39.58 
 
 		 148 aa  71.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  33 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  33.02 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  31.07 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  35.96 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  38.52 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  36.27 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  31.5 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  34.91 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  34.96 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  37.37 
 
 		 134 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 163 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  40 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  37.62 
 
 		 136 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  40 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>