245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1210 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  942    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  66.2 
 
 
446 aa  564  1.0000000000000001e-159  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  41.86 
 
 
419 aa  262  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  40.97 
 
 
390 aa  258  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  40.99 
 
 
448 aa  256  6e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  45.36 
 
 
428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  42.99 
 
 
386 aa  249  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  40.17 
 
 
434 aa  249  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  38.68 
 
 
525 aa  249  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  40.81 
 
 
364 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  43.81 
 
 
398 aa  247  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  41.75 
 
 
456 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  43.21 
 
 
501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  39.69 
 
 
531 aa  242  9e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  40.26 
 
 
479 aa  237  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  41.18 
 
 
459 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  36.83 
 
 
417 aa  237  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  41.47 
 
 
378 aa  237  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  43.33 
 
 
403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  36.54 
 
 
512 aa  236  7e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  40.06 
 
 
428 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  38.44 
 
 
494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  46.18 
 
 
403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  36.54 
 
 
486 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  35.07 
 
 
474 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  42.19 
 
 
523 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  35.31 
 
 
504 aa  232  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  38.05 
 
 
451 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  40.29 
 
 
545 aa  229  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  38.14 
 
 
443 aa  229  1e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  42.18 
 
 
366 aa  226  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  39.09 
 
 
434 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  39.73 
 
 
417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  38.64 
 
 
443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  37.61 
 
 
503 aa  221  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  42.36 
 
 
399 aa  219  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  39.79 
 
 
387 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  37.72 
 
 
445 aa  217  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  35.22 
 
 
462 aa  216  5e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  38.1 
 
 
391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  36.67 
 
 
473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  35.85 
 
 
493 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  38.06 
 
 
554 aa  212  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  34.29 
 
 
402 aa  209  7e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  39.86 
 
 
374 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  37.84 
 
 
442 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  40.07 
 
 
361 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  33.65 
 
 
425 aa  203  7e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  36.81 
 
 
431 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  29.93 
 
 
532 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  29.18 
 
 
548 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  29.97 
 
 
495 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  30.14 
 
 
531 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0033  RmuC domain-containing protein  30.68 
 
 
432 aa  159  7e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  29.7 
 
 
495 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  29.86 
 
 
495 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  30.11 
 
 
495 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0140  hypothetical protein  26.68 
 
 
407 aa  155  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  31.12 
 
 
491 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  27.03 
 
 
457 aa  153  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  30.99 
 
 
453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  31.39 
 
 
510 aa  152  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1614  hypothetical protein  32.59 
 
 
494 aa  151  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0228591  normal  0.73372 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  31.73 
 
 
424 aa  150  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  31.23 
 
 
492 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  28.38 
 
 
492 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  30.52 
 
 
420 aa  149  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  28.65 
 
 
492 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01951  RmuC  27.15 
 
 
429 aa  149  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  29.4 
 
 
506 aa  146  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  30.97 
 
 
470 aa  146  9e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  28.27 
 
 
485 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2433  hypothetical protein  30.97 
 
 
513 aa  144  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  28.35 
 
 
453 aa  143  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0018  RmuC domain-containing protein  30.18 
 
 
494 aa  143  8e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  26.15 
 
 
475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0247  hypothetical protein  29.13 
 
 
515 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1993  protein of unknown function DUF195  33.58 
 
 
479 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  26.62 
 
 
475 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  26.62 
 
 
475 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  26.62 
 
 
475 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  26.62 
 
 
475 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  26.62 
 
 
475 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  29.77 
 
 
640 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  26.62 
 
 
475 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001928  DNA recombination protein RmuC  30.69 
 
 
510 aa  140  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  29.55 
 
 
480 aa  140  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  26.83 
 
 
475 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  26.83 
 
 
475 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  28.36 
 
 
630 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0237  hypothetical protein  26.85 
 
 
626 aa  139  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0705649  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  27.86 
 
 
519 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3946  hypothetical protein  28.65 
 
 
501 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.737654  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  27.86 
 
 
519 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3642  RmuC domain-containing protein  28.65 
 
 
501 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0270  RmuC domain-containing protein  28.65 
 
 
501 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557179  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1422  protein of unknown function DUF195  26.93 
 
 
428 aa  139  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  28.41 
 
 
513 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  27.86 
 
 
519 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  27.86 
 
 
519 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>