57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1199 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1199  chorismate mutase  100 
 
 		 129 aa  261  3e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0113  chorismate mutase  56.36 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24350  monofunctional chorismate mutase  46.88 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.536021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0958  chorismate mutase  50.51 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.993568 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1123  chorismate mutase  53.33 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3751  chorismate mutase  50 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4074  chorismate mutase  48.86 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1078  chorismate mutase  50.51 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0126644  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09580  chorismate mutase  51 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3096  chorismate mutase  50 
 
 		 111 aa  94  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0663  chorismate mutase  46.73 
 
 		 115 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0652  chorismate mutase  46.73 
 
 		 115 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0670145  normal  0.113986 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4204  chorismate mutase  51.22 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47894  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  51.16 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0631  chorismate mutase  46.73 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3617  chorismate mutase  50 
 
 		 110 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  53.16 
 
 		 95 aa  87  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14790  chorismate mutase  42.11 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7204  chorismate mutase  50 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2451  chorismate mutase  47.78 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228493 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0060  chorismate mutase  45.54 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  hitchhiker  0.00833168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1396  chorismate mutase  51.81 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1825  chorismate mutase  50 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2720  chorismate mutase  45.56 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50851  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1757  chorismate mutase  50 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3880  chorismate mutase  46.67 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367176  normal  0.891954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  44.58 
 
 		 96 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1352  chorismate mutase  45.45 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3447  chorismate mutase  48.28 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734851  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3340  chorismate mutase  48.72 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.113481  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2606  chorismate mutase  42.22 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.0121912 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2710  chorismate mutase  39.56 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719316  normal  0.0295757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1049  chorismate mutase  39.56 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0180  chorismate mutase  41.98 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0349  chorismate mutase  41.25 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.365009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0750  chorismate mutase  41.25 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  29.89 
 
 		 358 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  29.55 
 
 		 358 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.89 
 
 		 358 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  39.13 
 
 		 381 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  34.57 
 
 		 333 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.53 
 
 		 384 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  31.33 
 
 		 456 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  34.72 
 
 		 381 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  36.59 
 
 		 386 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.96 
 
 		 393 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.82 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.24 
 
 		 375 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2907  Chorismate mutase  34.82 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000358105  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0315  chorismate mutase  30.88 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1599  chorismate mutase  30.88 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1029  chorismate mutase  30.88 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.809683  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.87 
 
 		 357 aa  40.8  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  34.62 
 
 		 366 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.99 
 
 		 373 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  32 
 
 		 475 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  29.67 
 
 		 374 aa  40  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>