More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1194 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1194  putative response regulator  100 
 
 		 266 aa  540  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0189  transcriptional regulatory protein, C-terminal domain protein  62.06 
 
 		 296 aa  335  5.999999999999999e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3035  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  64.26 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3090  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  65.53 
 
 		 241 aa  302  5.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04930  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  59.46 
 
 		 249 aa  298  8e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.793732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0439  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  60 
 
 		 248 aa  295  5e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.190602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3419  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  57.87 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0453  putative winged helix family two component transcriptional regulator  53.97 
 
 		 251 aa  275  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.275136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0895  response regulator receiver protein  56.05 
 
 		 237 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0595  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  58.8 
 
 		 237 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2025  response regulator receiver protein  54.79 
 
 		 261 aa  269  5e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0337  winged helix family two component response transcriptional regulator  53.78 
 
 		 239 aa  260  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4240  transcriptional regulator domain-containing protein  54.17 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466466  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0879  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  55.41 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.249855  hitchhiker  0.00478466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0293  winged helix family two component response transcriptional regulator  54.35 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4525  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 257 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4612  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 257 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4908  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 257 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4376  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  52.87 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6176  winged helix family two component response transcriptional regulator  56.84 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.186762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0443  response regulator receiver protein  56.41 
 
 		 250 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6823  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  54.11 
 
 		 250 aa  252  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2737  transcriptional regulatory protein  51.75 
 
 		 253 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4983  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  53.68 
 
 		 232 aa  251  8.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6372  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  52.77 
 
 		 236 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5097  response regulator receiver protein  55.07 
 
 		 267 aa  250  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8253  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  56.62 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4646  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  53.28 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1650  response regulator receiver protein  51.88 
 
 		 278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0110992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2724  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  50.85 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00387379 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3935  transcriptional regulator domain protein  49.4 
 
 		 270 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3012  response regulator receiver protein  50.65 
 
 		 232 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.721979  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10833  transcriptional regulatory protein  52.53 
 
 		 255 aa  234  9e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597919 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37670  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  52.79 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0528352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3545  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  51.9 
 
 		 243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61486  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03550  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.58 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.329191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6843  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  37.99 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12898  transcriptional regulator  38.72 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.385025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1126  transcriptional regulator  58.65 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000289398  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0241  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  63.44 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_944  transcriptional regulator  56.73 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0955  two component transcriptional regulator  55.77 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08240  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.2 
 
 		 236 aa  118  9e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.956318  normal  0.778898 
 
 
-
 
NC_002936  DET1162  transcriptional regulator, putative  36.23 
 
 		 238 aa  117  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.829609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  37.64 
 
 		 232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2015  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  43.07 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0839248  hitchhiker  0.0000000000000188648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.92 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2939  response regulator receiver  45.45 
 
 		 232 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  38.42 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19870  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.11 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.931606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  34.29 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.72 
 
 		 226 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  40.49 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  36 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  36 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 228 aa  105  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 228 aa  105  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  35.43 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.27 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  36 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  35.43 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  36 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1224  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117785  hitchhiker  0.00926138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  35.43 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  37.57 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  36 
 
 		 223 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  36.46 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  35.43 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  35.39 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  39.88 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  36.63 
 
 		 237 aa  104  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  36.41 
 
 		 235 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  35.2 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  35.2 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.23 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.2 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1922  two component transcriptional regulator  36.42 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  36.46 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  35.36 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.7 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.64 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  36.46 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  36.46 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  36.46 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  36.46 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  36.46 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  36.46 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  36.46 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 226 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  36.46 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.02 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  33.85 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  33.85 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  34.73 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>