117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1135 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1135  phage lysin-like lysozyme M1  100 
 
 		 411 aa  832    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1002  glycosyl hydrolase family 25  43.94 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0206  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  39.13 
 
 		 669 aa  138  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.09 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1416  glycoside hydrolase family 25  29.21 
 
 		 574 aa  72.4  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  26.48 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37940  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.07 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.530239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6875  Lysozyme  30.45 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1567  family 25 glycoside hydrolase  26.67 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.606598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  27.86 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  35.51 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  27.98 
 
 		 320 aa  57  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1363  glycoside hydrolase family 25  25.3 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  38.18 
 
 		 444 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  37.07 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6874  Lysozyme  26.88 
 
 		 282 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15700  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.51 
 
 		 266 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.43 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 496 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  38.6 
 
 		 568 aa  54.3  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.43 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.43 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.43 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.43 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  34.43 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.43 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.43 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2875  glycoside hydrolase family 25  26.6 
 
 		 265 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.737468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.71 
 
 		 348 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1529  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.56 
 
 		 348 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0110993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5378  lysozyme  28.77 
 
 		 323 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2409  Lysozyme  29.06 
 
 		 935 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.20099 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  37.86 
 
 		 307 aa  53.1  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 440 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08969  conserved hypothetical protein  27.52 
 
 		 216 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1568  glycosy hydrolase family protein  26.6 
 
 		 342 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00668816  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0050  autolytic lysozyme  26.73 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000251192  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3491  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 		 355 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.54069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2615  glycoside hydrolase family 25  27.09 
 
 		 265 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194004  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3713  glycosy hydrolase family protein  26.71 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2674  glycoside hydrolase family protein  30.7 
 
 		 829 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 661 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0635  glycoside hydrolase family protein  24.27 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0369  glycosy hydrolase family protein  27.5 
 
 		 342 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2755  Peptidoglycan-binding LysM  37.6 
 
 		 1147 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00369257  normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5377  Lysozyme  29.07 
 
 		 250 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27763 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11290  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  26.67 
 
 		 319 aa  50.4  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  37.61 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3364  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 		 348 aa  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000457616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29030  lysozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  27.16 
 
 		 331 aa  50.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.488385 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  29.1 
 
 		 265 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  29.1 
 
 		 265 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3109  glycoside hydrolase family protein  23.29 
 
 		 628 aa  49.7  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0595324  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06470  N,O-diacetylmuramidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ10]  25.85 
 
 		 216 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981734  normal  0.135585 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02030  predicted hydrolase  28.3 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0755  U32 family peptidase  24.22 
 
 		 282 aa  49.3  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.78 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01994  hypothetical protein  28.3 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0160  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  28.64 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648956  unclonable  1.03661e-27 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  34.55 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  37.63 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1555  glycoside hydrolase family 25  28.3 
 
 		 272 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1545  glycoside hydrolase family protein  28.3 
 
 		 272 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.78 
 
 		 455 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2238  glycosy hydrolase family protein  27.83 
 
 		 272 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  30.77 
 
 		 335 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5518  glycoside hydrolase family protein  24.2 
 
 		 294 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.198571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3414  glycoside hydrolase family 25  27.31 
 
 		 252 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.299944  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.78 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.78 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.78 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3246  lysozyme  20.95 
 
 		 245 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0552662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3219  hypothetical protein  20.95 
 
 		 245 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0169574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3501  lysozyme  20.95 
 
 		 245 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  32.04 
 
 		 253 aa  47.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0962  glycosy hydrolase family protein  27.83 
 
 		 272 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2390  glycosy hydrolase family protein  27.83 
 
 		 272 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0555  glycoside hydrolase family 25  26.8 
 
 		 380 aa  46.6  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.04 
 
 		 1001 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3565  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 		 263 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  29.51 
 
 		 518 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0973  glycosy hydrolase family protein  26 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0331893  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3248  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 		 263 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226396  normal  0.397621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6054  Lysozyme  25.71 
 
 		 241 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3156  hypothetical protein  25.6 
 
 		 263 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  31.31 
 
 		 267 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  30.77 
 
 		 563 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  26.47 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  37.07 
 
 		 733 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  35.11 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2185  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 		 260 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  35.24 
 
 		 142 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  35.19 
 
 		 542 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  34.71 
 
 		 560 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.85 
 
 		 455 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  38.64 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1136  glycosyl hydrolase family 25  27.36 
 
 		 272 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.284707  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  30.15 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2097  glycoside hydrolase family 25  21.33 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319373  normal  0.427488 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  31.78 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>