218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1128 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  100 
 
 
75 aa  141  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  64.86 
 
 
76 aa  99  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  67.14 
 
 
77 aa  96.7  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  64.29 
 
 
78 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  57.33 
 
 
74 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0143  putative F0F1 ATP synthase subunit C  58.57 
 
 
77 aa  86.3  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  54.05 
 
 
75 aa  84.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  56.52 
 
 
73 aa  83.6  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  54.55 
 
 
81 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  55.07 
 
 
74 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  52.05 
 
 
76 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  48 
 
 
76 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  58.73 
 
 
68 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
81 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  51.52 
 
 
82 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  47.83 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.53 
 
 
77 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  42.67 
 
 
74 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  46.48 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  47.89 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  53.12 
 
 
70 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  50 
 
 
72 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  40.3 
 
 
69 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18250  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  41.54 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447558  normal  0.275896 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  42.65 
 
 
71 aa  58.9  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  43.55 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  46.67 
 
 
91 aa  57  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  46.67 
 
 
91 aa  57  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  51.61 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  54.24 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  45.07 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  54.55 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  50.88 
 
 
77 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  50.88 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  53.33 
 
 
81 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  51.67 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  47.37 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3921  ATP synthase F0, C subunit  55.07 
 
 
73 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0515  F0F1 ATP synthase subunit C  47.06 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000303287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  50.98 
 
 
77 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  45.9 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0857  F0F1 ATP synthase subunit C  47.06 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00162341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  44 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  45.9 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  45.9 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  41.94 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  43.4 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  48.39 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  50.91 
 
 
75 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  44.16 
 
 
82 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  50.85 
 
 
88 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  36.84 
 
 
93 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  44.16 
 
 
82 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  36 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  44.16 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  52.17 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  46.67 
 
 
78 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04088  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
73 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0194198  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0057  F0F1 ATP synthase subunit C  47.37 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  42.67 
 
 
91 aa  50.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1435  F0F1 ATP synthase subunit C  41.51 
 
 
80 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213661  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  43.64 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1056  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  47.37 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  47.17 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  47.17 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  42.67 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  47.17 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  45 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  47.17 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  45.61 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0111  F0F1 ATP synthase subunit C  46.43 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00023938  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  47.27 
 
 
73 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  46.43 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  43.4 
 
 
73 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  39.71 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000094823  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000050881  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  34.21 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  45.28 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  47.27 
 
 
78 aa  48.9  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4612  F0F1 ATP synthase subunit C  48 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0947  F0F1 ATP synthase subunit C  38.6 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0801028  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0171  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.28 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>