293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1017 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  100 
 
 
238 aa  490  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  43.51 
 
 
238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  42.61 
 
 
233 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  37.13 
 
 
237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  36.62 
 
 
238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  38.08 
 
 
253 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  34.17 
 
 
238 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  35.9 
 
 
240 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  37.86 
 
 
251 aa  148  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  38.02 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  39.9 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  41.63 
 
 
237 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  38.68 
 
 
250 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  33.33 
 
 
241 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  38.4 
 
 
236 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  37.6 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  40.68 
 
 
236 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  37.4 
 
 
298 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  40.65 
 
 
243 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  37.3 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  40.68 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  40.68 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  40.74 
 
 
250 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  36.94 
 
 
233 aa  138  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  35.43 
 
 
279 aa  137  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  37.79 
 
 
230 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  35.71 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  32.88 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  37.89 
 
 
250 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  37.89 
 
 
250 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  36.07 
 
 
238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  33.76 
 
 
256 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  36.84 
 
 
259 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  35.25 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  38.79 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  34.47 
 
 
602 aa  130  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  35.53 
 
 
250 aa  129  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  42.37 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  39.45 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  35.15 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  33.33 
 
 
237 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  39.57 
 
 
259 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  40.4 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  40.4 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  35.85 
 
 
245 aa  125  8.000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  34.8 
 
 
253 aa  125  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  36.59 
 
 
242 aa  124  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  29.49 
 
 
241 aa  124  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  30.47 
 
 
233 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  31.42 
 
 
242 aa  123  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  40.2 
 
 
307 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  31.73 
 
 
244 aa  122  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  36.79 
 
 
272 aa  121  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08940  predicted glutamine amidotransferase  38.53 
 
 
244 aa  121  9e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0342497  normal  0.666279 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  37.38 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  39.3 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  41.18 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  35.45 
 
 
254 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  35.65 
 
 
238 aa  116  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  39.77 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  30.65 
 
 
312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  37.19 
 
 
356 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  37.19 
 
 
442 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  37.19 
 
 
442 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  37.19 
 
 
444 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  37.19 
 
 
442 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  39.77 
 
 
396 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  37.19 
 
 
444 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  39.77 
 
 
396 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  38.46 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  37.19 
 
 
444 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  39.77 
 
 
396 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  35.93 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  36.68 
 
 
444 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  32.65 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  37.44 
 
 
405 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  36.94 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  39.44 
 
 
427 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  36.8 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  37.44 
 
 
252 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  39.44 
 
 
399 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  39.88 
 
 
493 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  35.93 
 
 
269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  35.51 
 
 
242 aa  112  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0917  peptidase C26  34.68 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  35.06 
 
 
269 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  36 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  38.12 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  40 
 
 
479 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  31.95 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  35.35 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5208  peptidase C26  38 
 
 
295 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  34.63 
 
 
269 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1111  peptidase C26  40.38 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.517876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  33.6 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  38.37 
 
 
249 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3012  peptidase C26  36.93 
 
 
261 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90022  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  36.71 
 
 
313 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  35.15 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  34.41 
 
 
272 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>