More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1011 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  100 
 
 
607 aa  1243    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0401  long-chain acyl-CoA synthetase  51.86 
 
 
701 aa  621  1e-176  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  52.27 
 
 
679 aa  615  1e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  45.11 
 
 
618 aa  528  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  49.49 
 
 
602 aa  525  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  43.75 
 
 
603 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  48.05 
 
 
599 aa  511  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  47.58 
 
 
606 aa  510  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  46.76 
 
 
606 aa  509  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  46.7 
 
 
602 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  45.92 
 
 
606 aa  504  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  46.52 
 
 
604 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  44.46 
 
 
677 aa  486  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0860  AMP-binding enzyme  43.47 
 
 
682 aa  486  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  46.58 
 
 
622 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  46.35 
 
 
605 aa  481  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  44.57 
 
 
603 aa  477  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  45.93 
 
 
608 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  43.52 
 
 
598 aa  473  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.41 
 
 
597 aa  475  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  43.35 
 
 
599 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  44.97 
 
 
611 aa  467  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 
616 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  45.33 
 
 
600 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  43.02 
 
 
599 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  43.22 
 
 
602 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  42.88 
 
 
600 aa  458  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  43.64 
 
 
619 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  45.45 
 
 
600 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  43.81 
 
 
599 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  42.33 
 
 
599 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  41.24 
 
 
595 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  42.86 
 
 
597 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  44.95 
 
 
606 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  42.86 
 
 
597 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  42.86 
 
 
597 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  42.74 
 
 
607 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  44.33 
 
 
615 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  45.54 
 
 
593 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  44.33 
 
 
597 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  43.55 
 
 
599 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  42.99 
 
 
599 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  41.64 
 
 
601 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  42.04 
 
 
604 aa  439  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  42.11 
 
 
609 aa  438  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1274  AMP-dependent synthetase and ligase  43.9 
 
 
609 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000455356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  42.05 
 
 
615 aa  429  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  42.5 
 
 
602 aa  432  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  42.93 
 
 
600 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  41.84 
 
 
602 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  40.75 
 
 
612 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  40.42 
 
 
597 aa  411  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  40.83 
 
 
632 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  40.67 
 
 
597 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  41.07 
 
 
591 aa  401  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  39.62 
 
 
601 aa  401  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  42.55 
 
 
596 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  39.83 
 
 
606 aa  397  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  41.36 
 
 
612 aa  394  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1932  AMP-dependent synthetase and ligase  39.75 
 
 
590 aa  358  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333973  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 
604 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 
604 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 
602 aa  353  7e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 
602 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 
602 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 
604 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0944  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 
622 aa  349  8e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  35.94 
 
 
607 aa  349  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 
606 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 
612 aa  341  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 
602 aa  340  4e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 
605 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  35.46 
 
 
606 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  35.46 
 
 
606 aa  337  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 
594 aa  337  5.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 
597 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 
622 aa  332  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 
617 aa  331  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  35.68 
 
 
610 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 
592 aa  320  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  35.07 
 
 
612 aa  319  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 
607 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 
597 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 
601 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  33.17 
 
 
633 aa  310  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  33.55 
 
 
669 aa  309  8e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 
618 aa  309  9e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  34.59 
 
 
649 aa  309  9e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 
601 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 
598 aa  306  6e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 
613 aa  306  8.000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 
626 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 
623 aa  304  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 
601 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 
616 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 
598 aa  303  7.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 
601 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 
601 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 
630 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 
601 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>