More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0998 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0998  putative permease  100 
 
 		 548 aa  1100    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0354  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-2 (14 Spanner) (DHA2) family protein  63.53 
 
 		 542 aa  662    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.83 
 
 		 658 aa  278  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.5 
 
 		 657 aa  270  7e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  34.45 
 
 		 496 aa  266  5.999999999999999e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  32.87 
 
 		 683 aa  266  7e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  32.16 
 
 		 490 aa  265  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22510  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.82 
 
 		 494 aa  262  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.21 
 
 		 472 aa  261  3e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2756  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.29 
 
 		 471 aa  257  4e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2422  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.44 
 
 		 643 aa  256  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.845412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2376  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.44 
 
 		 643 aa  256  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.15 
 
 		 496 aa  253  9.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  33.92 
 
 		 465 aa  250  5e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.19 
 
 		 513 aa  248  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30 
 
 		 513 aa  247  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  31.14 
 
 		 492 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 		 492 aa  246  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.94 
 
 		 492 aa  246  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.94 
 
 		 492 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.94 
 
 		 492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.14 
 
 		 492 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.14 
 
 		 492 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2198  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.24 
 
 		 481 aa  244  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0460557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2236  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.24 
 
 		 481 aa  244  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.126562  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1519  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 502 aa  243  7e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  30.94 
 
 		 492 aa  243  9e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.66 
 
 		 635 aa  240  5.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 479 aa  240  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 479 aa  240  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.04 
 
 		 561 aa  239  6.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08630  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.47 
 
 		 509 aa  233  6e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.7 
 
 		 490 aa  232  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.83 
 
 		 599 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.42 
 
 		 479 aa  231  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.52 
 
 		 597 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.81 
 
 		 484 aa  229  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.55 
 
 		 570 aa  229  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.06 
 
 		 482 aa  229  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 499 aa  229  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00395265  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.04 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.08 
 
 		 599 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 		 579 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  33.1 
 
 		 599 aa  228  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 		 599 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.1 
 
 		 599 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 		 599 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.86 
 
 		 599 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  32.86 
 
 		 599 aa  226  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23660  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.1 
 
 		 461 aa  226  6e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.629317  normal  0.503051 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.48 
 
 		 599 aa  226  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.87 
 
 		 489 aa  226  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.55 
 
 		 564 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.73 
 
 		 620 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.96 
 
 		 483 aa  223  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257317  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_0161  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.25 
 
 		 494 aa  223  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.89 
 
 		 491 aa  219  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.22 
 
 		 500 aa  211  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000893352  hitchhiker  0.00471574 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1378  major facilitator superfamily permease  30.53 
 
 		 512 aa  210  6e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0602023  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05820  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.11 
 
 		 510 aa  209  8e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1383  major facilitator superfamily permease  32.71 
 
 		 519 aa  209  9e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.601618  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.76 
 
 		 492 aa  207  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1880  major facilitator superfamily permease  31.9 
 
 		 503 aa  207  5e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.91 
 
 		 490 aa  206  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2667  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.51 
 
 		 485 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0905281  normal  0.424193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02600  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.85 
 
 		 505 aa  203  6e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1468  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.44 
 
 		 491 aa  203  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.986472  normal  0.151461 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0959  permease, general substrate transporter  32.05 
 
 		 482 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0281229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.65 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1003  lincomycin resistance protein LmrB  30.32 
 
 		 480 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.05 
 
 		 482 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0734  lincomycin resistance protein  30.32 
 
 		 480 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.498733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0949  permease, general substrate transporter  32.28 
 
 		 482 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000025972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1038  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.05 
 
 		 482 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0888  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 		 486 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 		 486 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11090  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 		 640 aa  200  5e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000431734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1116  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.05 
 
 		 482 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000271146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.7 
 
 		 487 aa  200  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1115  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.22 
 
 		 491 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1028  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.98 
 
 		 491 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10576e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0988  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.66 
 
 		 491 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4325  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.76 
 
 		 491 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1318  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.38 
 
 		 465 aa  191  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14700  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.79 
 
 		 491 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0438074  normal  0.116411 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1423  major facilitator superfamily permease  31.14 
 
 		 464 aa  177  4e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.904673  hitchhiker  0.0000661431 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1853  major facilitator superfamily permease  30.54 
 
 		 471 aa  177  5e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5520  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.42 
 
 		 502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1299  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.85 
 
 		 579 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0360  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 		 501 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
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NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.48 
 
 		 520 aa  160  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.53 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.86 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4220  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.81 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663619  n/a   
 
 
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NC_008531  LEUM_0546  major facilitator superfamily permease  29.13 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000674821  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.48 
 
 		 520 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.64 
 
 		 510 aa  159  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.64 
 
 		 503 aa  159  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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