More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0988 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 124 aa  242  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  54.87 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  60.91 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  55.86 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  49.14 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  47.83 
 
 		 123 aa  121  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  47.83 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  47.83 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  47.83 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  46.77 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  48.7 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  46.36 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  46.36 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  44.8 
 
 		 154 aa  116  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  50 
 
 		 123 aa  115  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  52.5 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  47.83 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  55.56 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  47.83 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  48.7 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  46.96 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  50.41 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  50.41 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  53.85 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  46.55 
 
 		 123 aa  114  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  42.4 
 
 		 123 aa  114  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  48.65 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  47.27 
 
 		 139 aa  113  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  50 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  49.57 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  41.94 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  45.22 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  43.44 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  44.74 
 
 		 132 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  41.46 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  44.74 
 
 		 132 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  45.22 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  44.35 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  46.36 
 
 		 117 aa  110  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  44.55 
 
 		 125 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  46.09 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  48.7 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  47.27 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  51.43 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  43.48 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  44.74 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  44.55 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  41.67 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  48.18 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  42.28 
 
 		 122 aa  107  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  45.45 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  45.45 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  41.73 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  41.74 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  48.25 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  50 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  43.9 
 
 		 123 aa  104  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  42.73 
 
 		 120 aa  103  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  44.8 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  38.6 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  40.98 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  40.98 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  44.74 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  44.44 
 
 		 125 aa  93.6  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  43.52 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  39.29 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  42.59 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  44.23 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  43.69 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  42.31 
 
 		 178 aa  90.1  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  43.69 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  45.19 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  45.19 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  46.15 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  42.31 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  43.27 
 
 		 170 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  41.67 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  40.4 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  40.4 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  40.4 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  40.4 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  40.4 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  41.18 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  40.38 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  42.72 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  39.39 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  39.39 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  39.39 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  39.39 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  39.39 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  39.39 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  39.39 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  39.39 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  39.39 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  43.82 
 
 		 104 aa  87  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  43.14 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  42.31 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  35.09 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  42.31 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  42.31 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>