177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0973 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  100 
 
 
416 aa  850    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2211  galactokinase  50.71 
 
 
414 aa  364  1e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.173587  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  53.04 
 
 
407 aa  362  7.0000000000000005e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0758  galactokinase  48.74 
 
 
429 aa  350  4e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.558541  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2490  galactokinase  51.66 
 
 
409 aa  347  3e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32880  galactokinase  51.36 
 
 
409 aa  342  5.999999999999999e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226542  normal  0.212245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3973  galactokinase  49.04 
 
 
408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.340727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  47.87 
 
 
389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  47.63 
 
 
394 aa  300  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  44.15 
 
 
399 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  42.29 
 
 
385 aa  282  7.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  44.16 
 
 
395 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24040  galactokinase  46.52 
 
 
420 aa  279  6e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  45.27 
 
 
403 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  40.83 
 
 
391 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  42.86 
 
 
372 aa  269  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  41.84 
 
 
401 aa  265  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  43.04 
 
 
400 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4902  galactokinase  44.56 
 
 
379 aa  260  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  41.57 
 
 
418 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  43.37 
 
 
376 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  42.49 
 
 
373 aa  237  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  36.95 
 
 
388 aa  220  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  37.3 
 
 
359 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  36.3 
 
 
388 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  37.5 
 
 
392 aa  213  5.999999999999999e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  36.9 
 
 
387 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  39.4 
 
 
398 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  40.5 
 
 
349 aa  210  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  35.01 
 
 
387 aa  211  3e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  40.79 
 
 
363 aa  209  7e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  36.88 
 
 
388 aa  209  8e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  35.22 
 
 
386 aa  204  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  35.53 
 
 
385 aa  203  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  34.79 
 
 
389 aa  202  8e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  34.9 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  33.66 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  34.95 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  35.01 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  34.44 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  34.4 
 
 
389 aa  200  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  35.73 
 
 
386 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  36.87 
 
 
386 aa  199  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  35.99 
 
 
414 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  35.7 
 
 
403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  34.07 
 
 
404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  35.16 
 
 
405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  38.3 
 
 
387 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  35.75 
 
 
387 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  33.85 
 
 
392 aa  197  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  35.19 
 
 
383 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  32.89 
 
 
412 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  34.22 
 
 
382 aa  193  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  34.22 
 
 
382 aa  192  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  34.22 
 
 
382 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  34.22 
 
 
382 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  34.22 
 
 
382 aa  192  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  35.31 
 
 
385 aa  192  7e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  33.16 
 
 
388 aa  192  9e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  37.3 
 
 
388 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  35.38 
 
 
381 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  35.38 
 
 
381 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  35.38 
 
 
381 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  35.38 
 
 
381 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  35.04 
 
 
405 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  35.31 
 
 
382 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  35.29 
 
 
381 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  33.69 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  33.95 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  35.46 
 
 
389 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  39.6 
 
 
349 aa  190  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  35.92 
 
 
391 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  34.73 
 
 
395 aa  189  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  33.5 
 
 
383 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  32.98 
 
 
382 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  36.68 
 
 
399 aa  189  9e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  32.98 
 
 
382 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  32.98 
 
 
382 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  32.71 
 
 
382 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  38.42 
 
 
362 aa  188  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  32.48 
 
 
387 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  33.51 
 
 
385 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  35.62 
 
 
356 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  32.23 
 
 
387 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  33.76 
 
 
392 aa  187  3e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  32.71 
 
 
382 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  33.42 
 
 
379 aa  186  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  33.5 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  34.76 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  34.11 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  35.1 
 
 
381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  33.33 
 
 
382 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  33.42 
 
 
358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  34.26 
 
 
381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  34.74 
 
 
391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  35.36 
 
 
357 aa  183  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  35.09 
 
 
383 aa  183  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  34.49 
 
 
380 aa  182  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  31.97 
 
 
394 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3451  galactokinase  36.28 
 
 
440 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>