More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0921 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  100 
 
 		 458 aa  941    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  63.76 
 
 		 480 aa  612  9.999999999999999e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  48.81 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  47.13 
 
 		 450 aa  439  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  40.05 
 
 		 449 aa  313  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  38.57 
 
 		 438 aa  306  5.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  40.81 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  41.13 
 
 		 449 aa  302  1e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  35.4 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 		 445 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  29.61 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  30.12 
 
 		 440 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  28.5 
 
 		 439 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.1 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.91 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 		 454 aa  140  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  28.76 
 
 		 445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.33 
 
 		 431 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  28.9 
 
 		 457 aa  124  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 		 440 aa  123  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  27.72 
 
 		 437 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  28.36 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  29.09 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  28.45 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 452 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.87 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  29.49 
 
 		 424 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 424 aa  94.7  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 504 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 410 aa  91.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 467 aa  90.1  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 421 aa  89  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 		 421 aa  87.8  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.95 
 
 		 407 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.38 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.36 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.97 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 432 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  30.1 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.31 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  22.47 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.84 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  36.17 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  27.2 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  27.2 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  22.46 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  22.46 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.84 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  21.88 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.51 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>