296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0883 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 
307 aa  620  1e-177  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  46.33 
 
 
398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  32.56 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  33.8 
 
 
330 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  32.47 
 
 
339 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  31.12 
 
 
343 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33.46 
 
 
320 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  33.08 
 
 
393 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33.08 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33.08 
 
 
320 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33.08 
 
 
320 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  33.08 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  30.55 
 
 
330 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  33.08 
 
 
291 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  30.47 
 
 
317 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.93 
 
 
308 aa  142  6e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  29.35 
 
 
322 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 
324 aa  142  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  34.24 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  33.9 
 
 
298 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  33.9 
 
 
298 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  31.83 
 
 
309 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  31.01 
 
 
333 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  31 
 
 
304 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  31.6 
 
 
303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  31.6 
 
 
303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  31.78 
 
 
304 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  31.6 
 
 
303 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  30.87 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  30.3 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  29.64 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  31.37 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  31.48 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.96 
 
 
296 aa  125  7e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.68 
 
 
297 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395362  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.46 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  27.51 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  27.21 
 
 
303 aa  119  7.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.65 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  29.25 
 
 
296 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  28.09 
 
 
310 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  25.78 
 
 
321 aa  113  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  27.87 
 
 
328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000812872 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  27.78 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.4 
 
 
301 aa  106  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  30.4 
 
 
298 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  31.74 
 
 
310 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  28.79 
 
 
511 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  28.24 
 
 
329 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  28.14 
 
 
306 aa  94.7  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  26.95 
 
 
312 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  27.94 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  24.21 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  23.89 
 
 
515 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  23.89 
 
 
515 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  26.34 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  29.36 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  25.3 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  23.13 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  24.9 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  25.09 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  27 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  23.05 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.81 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  26.79 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  25.89 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0282  periplasmic solute binding protein  27.19 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000440667  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  23.66 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  30.5 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  23.66 
 
 
311 aa  68.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  25.22 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  25.1 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  28.77 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  29.03 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4439  periplasmic solute binding protein  25.63 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  22.88 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  32.43 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25.21 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25.21 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1388  periplasmic solute binding protein  27.87 
 
 
312 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  0.503002 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25.21 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  27.72 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  25.99 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25.21 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25.21 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  23.57 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  25.97 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  23.28 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  25.4 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  25.4 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  23.55 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  23.55 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  25.1 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  25.73 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  25.59 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1663  putative ABC transporter substrate-binding protein  26.02 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.315809  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  27.85 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  26.46 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>