More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0875 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0875  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  100 
 
 
287 aa  579  1e-164  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00496425  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3557  extracellular solute-binding protein family 3  42.35 
 
 
290 aa  195  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.838933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0757  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 
291 aa  195  8.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.953109  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6884  extracellular solute-binding protein family 3  40.77 
 
 
285 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3098  extracellular solute-binding protein family 3  40.43 
 
 
293 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2775  extracellular solute-binding protein family 3  42.97 
 
 
294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9353  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein, putative  40.89 
 
 
286 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5107  extracellular solute-binding protein  39.71 
 
 
286 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4575  extracellular solute-binding protein  36.55 
 
 
297 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2804  extracellular solute-binding protein family 3  34.98 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0661  extracellular solute-binding protein family 3  31.18 
 
 
279 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000289878  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7637  extracellular solute-binding protein, family 3  29.62 
 
 
290 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2603  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 
262 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426319  hitchhiker  0.00328337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  32.56 
 
 
267 aa  99  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3149  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  32.12 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 
261 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18700  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  30.11 
 
 
273 aa  92.8  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.7204  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  31.14 
 
 
265 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3102  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 
269 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4079  extracellular solute-binding protein family 3  33.2 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.711512  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  30.95 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3756  extracellular solute-binding protein family 3  32.78 
 
 
265 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.720347  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 
265 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.56 
 
 
264 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  28.63 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 
265 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 
253 aa  87  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.37 
 
 
265 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.74 
 
 
265 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.37 
 
 
265 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.37 
 
 
265 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.37 
 
 
265 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
254 aa  86.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.37 
 
 
265 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.37 
 
 
265 aa  85.9  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.37 
 
 
265 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.69 
 
 
264 aa  85.9  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29 
 
 
265 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  28.2 
 
 
266 aa  85.5  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  31.52 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.08 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  30.45 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  28.99 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  28.99 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.08 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.08 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  30.37 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  30.45 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  30.45 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  28.99 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  30.77 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.88 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.17 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  30 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.17 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.17 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.17 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.17 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  29.45 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.17 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  31.14 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  29.14 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.14 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  29.14 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.14 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  27.74 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  27.74 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.14 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  27.76 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  27.72 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.78 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  28.42 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.08 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.97 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  27.72 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 
260 aa  79  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.14 
 
 
264 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  26.62 
 
 
272 aa  79  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.03 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.54 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.69 
 
 
250 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.69 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4626  arginine/ornithine binding protein AotJ  27.35 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1525  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.490796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>