More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0753 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0753  putative response regulator  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0596  response regulator receiver domain protein  72.08 
 
 		 250 aa  366  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.67 
 
 		 243 aa  316  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1802  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.44 
 
 		 232 aa  315  4e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09580  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  65.79 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1230  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.78 
 
 		 254 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.94 
 
 		 242 aa  299  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1221  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.58 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.655279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19400  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  61.25 
 
 		 279 aa  287  9e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0470356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7562  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.03 
 
 		 273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.320599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.93 
 
 		 225 aa  265  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5525  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.76 
 
 		 234 aa  254  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.997238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6208  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.19 
 
 		 226 aa  247  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1549  response regulator receiver protein  55.16 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.35 
 
 		 233 aa  191  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 229 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.6 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.83 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  43.53 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  43.53 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  43.53 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  43.53 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  43.53 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  43.53 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  43.53 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 234 aa  185  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 230 aa  184  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  43.53 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  43.53 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  41.88 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.59 
 
 		 239 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.98 
 
 		 237 aa  183  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  44.1 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  43.91 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  43.91 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  43.91 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.8 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.4 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 406 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  46.43 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  42.86 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.81 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  41.53 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.37 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1612  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00249249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0905  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 238 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.19 
 
 		 243 aa  179  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  44.74 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.49 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0977  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  41.28 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  40.85 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  44.93 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.5 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4990  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  41.38 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.87 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.4 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.67 
 
 		 231 aa  175  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1059  two component transcriptional regulator  43.93 
 
 		 242 aa  175  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.346912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>