More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0720 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 232 aa  476  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  41.25 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  39.25 
 
 		 281 aa  165  4e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  41.78 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  41.85 
 
 		 232 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  38.97 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  35.51 
 
 		 243 aa  98.6  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 		 198 aa  98.2  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  36.07 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  34.42 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  34.11 
 
 		 207 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  34.58 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  33.49 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  41.59 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  85.1  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  40.48 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  40.17 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  36.43 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.24 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  42.48 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  29.46 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  29.46 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  29.46 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  36.43 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  37.01 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  37.01 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  37.01 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  37.01 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  34.29 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  30.45 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  34.29 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  34.29 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  38.39 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  30.04 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  38.94 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  30.68 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  31.39 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  29.25 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  33.73 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.67 
 
 		 427 aa  72  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.74 
 
 		 442 aa  72  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  39.05 
 
 		 196 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 196 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  33.57 
 
 		 220 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.59 
 
 		 442 aa  71.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  26.44 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 		 190 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  35.46 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.35 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  36.44 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.74 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  36.44 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  31.9 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  36.28 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  31.92 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  32.1 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  33.64 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  33.02 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  29.47 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  25.46 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30400  predicted protein  31.1 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.923581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  29.46 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  26.9 
 
 		 212 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  26.9 
 
 		 212 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  33.57 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>