38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0607 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0607  hypothetical protein  100 
 
 
531 aa  1082    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0906909  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  26.2 
 
 
574 aa  125  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  25.81 
 
 
507 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0300  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  22.96 
 
 
605 aa  89.7  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.14 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.96 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.46 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.53 
 
 
396 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.99 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.96 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03640  Ykud domain-containing protein  24.9 
 
 
521 aa  69.3  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000350594  normal  0.0100407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.13 
 
 
376 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.58 
 
 
177 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  23.33 
 
 
636 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3025  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.43 
 
 
492 aa  57.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.379639  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  27.8 
 
 
847 aa  57.4  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.15 
 
 
206 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.47 
 
 
257 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.26 
 
 
171 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.39 
 
 
171 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2208  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.03 
 
 
552 aa  52.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.827056  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  25.97 
 
 
420 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  25.97 
 
 
420 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  25.97 
 
 
420 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  25.97 
 
 
420 aa  51.6  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  25.41 
 
 
420 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  26.09 
 
 
420 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  23.83 
 
 
417 aa  50.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0042  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.1 
 
 
866 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  24.31 
 
 
420 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.34 
 
 
155 aa  48.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  26.22 
 
 
420 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.34 
 
 
170 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  24.86 
 
 
420 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1958  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  22.59 
 
 
498 aa  47  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00199371  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  22.41 
 
 
636 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1018  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.31 
 
 
481 aa  44.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2863  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.63 
 
 
339 aa  44.3  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.772314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>