215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0579 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0579  glycerate kinase  100 
 
 		 353 aa  689    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.513033  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  52.27 
 
 		 373 aa  332  4e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  52.27 
 
 		 373 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  55.24 
 
 		 384 aa  328  8e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  50.57 
 
 		 386 aa  319  5e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  56.08 
 
 		 382 aa  318  9e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  53.82 
 
 		 380 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  54.39 
 
 		 378 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  56.66 
 
 		 381 aa  316  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  52.69 
 
 		 378 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  52.41 
 
 		 378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  50 
 
 		 381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  52.69 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  53.41 
 
 		 379 aa  313  3.9999999999999997e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  54.3 
 
 		 380 aa  309  4e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  51 
 
 		 379 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  47.01 
 
 		 380 aa  309  5.9999999999999995e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  51.27 
 
 		 377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  52.57 
 
 		 381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  51.02 
 
 		 382 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  51.02 
 
 		 382 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  51.02 
 
 		 382 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  51.02 
 
 		 382 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  53.28 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  50.86 
 
 		 383 aa  302  6.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  50.56 
 
 		 381 aa  302  7.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  46.49 
 
 		 378 aa  302  7.000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  49.01 
 
 		 381 aa  302  8.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  47.48 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  54.57 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  50.42 
 
 		 387 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  53.54 
 
 		 381 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  52.78 
 
 		 388 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  49.86 
 
 		 381 aa  300  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  44.6 
 
 		 384 aa  299  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  49.86 
 
 		 381 aa  299  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  49.86 
 
 		 381 aa  299  5e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  51.8 
 
 		 379 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  49.58 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  49.58 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  49.58 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  49.57 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  49.58 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  49.58 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  50.86 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  49.72 
 
 		 381 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  50 
 
 		 381 aa  296  5e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  47.4 
 
 		 394 aa  295  8e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  50.14 
 
 		 381 aa  295  9e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  52.82 
 
 		 380 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  49.3 
 
 		 381 aa  293  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  47.18 
 
 		 380 aa  293  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  47.18 
 
 		 380 aa  293  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  54.7 
 
 		 379 aa  293  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  52.29 
 
 		 388 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  49.86 
 
 		 381 aa  293  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  53.29 
 
 		 395 aa  292  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  52.29 
 
 		 388 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  50.14 
 
 		 384 aa  292  6e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  52.29 
 
 		 388 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  51.43 
 
 		 394 aa  292  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  48.98 
 
 		 381 aa  291  8e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  50.88 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  48.69 
 
 		 381 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  50.71 
 
 		 379 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  48.98 
 
 		 381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  52.6 
 
 		 381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  50.71 
 
 		 379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  50.71 
 
 		 379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  50.71 
 
 		 379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  48.98 
 
 		 381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  51.85 
 
 		 379 aa  289  6e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  48.98 
 
 		 381 aa  288  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  48.98 
 
 		 381 aa  288  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  48.98 
 
 		 381 aa  288  9e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  49.15 
 
 		 380 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  46.03 
 
 		 403 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  49.15 
 
 		 380 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  48.69 
 
 		 381 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  48.86 
 
 		 380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  52.12 
 
 		 380 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  48.86 
 
 		 380 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  53.54 
 
 		 381 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2952  glycerate kinase  51.16 
 
 		 386 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  48.86 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  45.89 
 
 		 402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  47.66 
 
 		 381 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  51.04 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  47.31 
 
 		 379 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  49.72 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  45.36 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0622  glycerate kinase  49.72 
 
 		 383 aa  280  3e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  46.69 
 
 		 381 aa  279  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  47.37 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  46.44 
 
 		 378 aa  278  8e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  47.73 
 
 		 380 aa  278  8e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  46.8 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  49.03 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  47.43 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  47.31 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>