More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0467 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  62.75 
 
 		 877 aa  1090    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  100 
 
 		 863 aa  1786    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.95 
 
 		 981 aa  588  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.71 
 
 		 950 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.77 
 
 		 996 aa  572  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  52.61 
 
 		 972 aa  572  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  52.57 
 
 		 904 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  55.37 
 
 		 952 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50 
 
 		 984 aa  558  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  53.06 
 
 		 918 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.57 
 
 		 933 aa  549  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.42 
 
 		 964 aa  547  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  51.49 
 
 		 909 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  50.87 
 
 		 936 aa  543  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.67 
 
 		 950 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  49.92 
 
 		 994 aa  537  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  49.16 
 
 		 947 aa  538  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  52.28 
 
 		 906 aa  539  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  52.2 
 
 		 916 aa  535  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  52.43 
 
 		 935 aa  529  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.79 
 
 		 919 aa  524  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.36 
 
 		 922 aa  525  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.54 
 
 		 931 aa  522  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.45 
 
 		 929 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.36 
 
 		 951 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  49.3 
 
 		 953 aa  511  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  50.18 
 
 		 906 aa  510  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.82 
 
 		 951 aa  510  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50.27 
 
 		 918 aa  505  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.27 
 
 		 918 aa  505  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.18 
 
 		 918 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.6 
 
 		 921 aa  498  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.37 
 
 		 917 aa  495  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46 
 
 		 990 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.59 
 
 		 932 aa  474  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.74 
 
 		 815 aa  414  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  39.56 
 
 		 889 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  40.82 
 
 		 893 aa  360  6e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.74 
 
 		 952 aa  355  1e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  39.09 
 
 		 905 aa  351  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  41.41 
 
 		 908 aa  349  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  41.82 
 
 		 908 aa  349  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  40.08 
 
 		 1055 aa  347  5e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  39.81 
 
 		 924 aa  347  6e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  38.87 
 
 		 924 aa  347  8e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  41.21 
 
 		 908 aa  343  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  42.06 
 
 		 919 aa  342  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  40.56 
 
 		 926 aa  338  1.9999999999999998e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  39.01 
 
 		 908 aa  337  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.38 
 
 		 927 aa  336  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  39.38 
 
 		 927 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  37.37 
 
 		 890 aa  335  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  36.79 
 
 		 1003 aa  328  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  29.11 
 
 		 1185 aa  322  3e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  37.7 
 
 		 1239 aa  306  9.000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  36.88 
 
 		 1175 aa  301  5e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.16 
 
 		 762 aa  287  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  35.12 
 
 		 1068 aa  287  7e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  32.08 
 
 		 1068 aa  283  1e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  35.66 
 
 		 872 aa  279  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  34.08 
 
 		 1073 aa  276  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  35.56 
 
 		 933 aa  275  3e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  58.72 
 
 		 961 aa  272  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  48.64 
 
 		 1026 aa  270  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  33.03 
 
 		 998 aa  257  6e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  64.43 
 
 		 940 aa  256  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.87 
 
 		 709 aa  244  6e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.03 
 
 		 843 aa  242  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  38.19 
 
 		 967 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  38.19 
 
 		 967 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  52.97 
 
 		 924 aa  199  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.18 
 
 		 424 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  34.5 
 
 		 1209 aa  176  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.64 
 
 		 715 aa  154  8e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  39.22 
 
 		 1293 aa  140  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.36 
 
 		 838 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.5 
 
 		 707 aa  131  6e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  30.65 
 
 		 1023 aa  131  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.44 
 
 		 710 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.69 
 
 		 950 aa  127  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.22 
 
 		 835 aa  125  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.54 
 
 		 832 aa  124  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.87 
 
 		 827 aa  124  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.76 
 
 		 817 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.83 
 
 		 847 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.32 
 
 		 848 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.2 
 
 		 837 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2083  DSH domain protein  23.98 
 
 		 516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00750043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  37 
 
 		 869 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  37.7 
 
 		 842 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  36.57 
 
 		 891 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  38.29 
 
 		 830 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.96 
 
 		 861 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.96 
 
 		 861 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.19 
 
 		 847 aa  118  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.89 
 
 		 876 aa  118  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  30.66 
 
 		 860 aa  117  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.06 
 
 		 852 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.06 
 
 		 852 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.06 
 
 		 852 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>