46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0424 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  100 
 
 
1181 aa  2417    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  27.4 
 
 
1120 aa  257  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  26.54 
 
 
1125 aa  250  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  25.09 
 
 
1151 aa  229  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  26.71 
 
 
1114 aa  207  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  24.6 
 
 
1124 aa  196  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  26.51 
 
 
1126 aa  194  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  25.13 
 
 
1118 aa  189  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  22.79 
 
 
1137 aa  179  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  25.6 
 
 
1146 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  24.26 
 
 
1154 aa  175  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  23.06 
 
 
1128 aa  173  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  25.5 
 
 
1143 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  24.41 
 
 
1153 aa  125  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  21.77 
 
 
1136 aa  122  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  23.17 
 
 
1130 aa  122  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  22.96 
 
 
1125 aa  120  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  23.23 
 
 
1123 aa  118  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  22.42 
 
 
1124 aa  113  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  24.65 
 
 
1140 aa  112  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  21.7 
 
 
1122 aa  109  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  21.51 
 
 
1133 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  21.19 
 
 
1121 aa  96.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  23.6 
 
 
1133 aa  94.7  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  22.58 
 
 
1144 aa  90.5  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  21.26 
 
 
1143 aa  86.7  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  22.08 
 
 
979 aa  85.9  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  21.02 
 
 
1121 aa  82  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  24.09 
 
 
1126 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  24.44 
 
 
1120 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  24.04 
 
 
1120 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  24.44 
 
 
1120 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  25.09 
 
 
1121 aa  80.1  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  24.25 
 
 
1118 aa  79  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  23.22 
 
 
1045 aa  76.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  22.14 
 
 
694 aa  75.5  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  23.17 
 
 
1121 aa  74.7  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  22.65 
 
 
1125 aa  73.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  28.16 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  24.17 
 
 
1166 aa  68.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  21.85 
 
 
1121 aa  65.1  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  22.41 
 
 
1121 aa  62.4  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  27.34 
 
 
1120 aa  62  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  25.3 
 
 
462 aa  58.9  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  33.75 
 
 
664 aa  45.8  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  32.2 
 
 
406 aa  45.4  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>