More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0407 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0407  ribosome recycling factor  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00332415  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  85.16 
 
 		 184 aa  317  5e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  56.18 
 
 		 185 aa  217  7.999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  55.62 
 
 		 185 aa  215  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  56.18 
 
 		 186 aa  213  9e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  55.62 
 
 		 185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  56.18 
 
 		 185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1370  ribosome recycling factor  56.74 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102814  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1418  ribosome recycling factor  53.93 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  52.25 
 
 		 185 aa  207  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  52.81 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  51.12 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2201  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23580  ribosome recycling factor  54.49 
 
 		 185 aa  203  9e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.275445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  52.81 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2504  ribosome recycling factor  53.93 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06770  ribosome recycling factor  53.89 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000531316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  51.12 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  52.25 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  51.69 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10150  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 188 aa  194  8.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 185 aa  190  8e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  51.65 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 185 aa  188  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1487  ribosome recycling factor  53.93 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  184  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3407  ribosome recycling factor  53.04 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0276302  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 184 aa  181  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  180  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  178  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  50.85 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 181 aa  174  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  46.11 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  47.43 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  44.75 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  46.33 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  46.86 
 
 		 186 aa  171  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2424  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  170  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00108894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 183 aa  170  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  46.82 
 
 		 173 aa  170  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0521  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 182 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  46.63 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  45.45 
 
 		 182 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  43.96 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05771  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 182 aa  168  5e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 184 aa  167  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  45.51 
 
 		 186 aa  167  7e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05851  ribosome recycling factor  50.87 
 
 		 182 aa  167  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  43.96 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  47.46 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  48.02 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  43.5 
 
 		 192 aa  166  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  42.54 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  43.65 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05471  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  45.86 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0629  ribosome recycling factor  41.48 
 
 		 190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.701086  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  45.3 
 
 		 184 aa  165  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  45.3 
 
 		 184 aa  165  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4945  ribosome recycling factor  45.4 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  43.96 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  45.05 
 
 		 186 aa  164  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  45.2 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0710  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 182 aa  164  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  45.4 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  45.71 
 
 		 176 aa  164  8e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  46.15 
 
 		 184 aa  164  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0745  ribosome recycling factor  44.38 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000436383  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  47.78 
 
 		 187 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  44.2 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>