More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0308 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2193  GTP pyrophosphokinase  42.64 
 
 
726 aa  662  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1680  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  45.32 
 
 
717 aa  652  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0127021 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0704  GTP diphosphokinase  82.54 
 
 
783 aa  1327  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12190  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.6 
 
 
716 aa  650  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.55141e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3187  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.79 
 
 
714 aa  654  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190275  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1805  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  58.21 
 
 
827 aa  885  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.388708  decreased coverage  7.28185e-06 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04010  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  44.44 
 
 
856 aa  658  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.710721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1698  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  55.75 
 
 
766 aa  857  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0806  GTP diphosphokinase  44.23 
 
 
734 aa  639  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000171798  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0947  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.64 
 
 
721 aa  707  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.452547  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12840  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  53 
 
 
759 aa  798  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00420725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2359  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  59.08 
 
 
793 aa  941  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3171  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  57.72 
 
 
861 aa  887  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100702  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1951  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.72 
 
 
726 aa  647  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2097  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.15 
 
 
725 aa  643  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2319  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  55.05 
 
 
806 aa  840  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.528198  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1376  (p)ppGpp synthetase I  55.05 
 
 
862 aa  845  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal  0.0959859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6106  GTP diphosphokinase  57.6 
 
 
785 aa  897  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364718  normal  0.643206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1815  RelA/SpoT family protein  58.07 
 
 
815 aa  884  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.093472  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.56 
 
 
742 aa  694  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2280  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  55.05 
 
 
801 aa  839  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.753689  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17580  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  62.63 
 
 
775 aa  991  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.091974 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1904  GTP pyrophosphokinase  42.39 
 
 
726 aa  655  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0308  Guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  100 
 
 
774 aa  1599  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00325244  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3380  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  52.7 
 
 
822 aa  793  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000200325  hitchhiker  0.00033219 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0733  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.51 
 
 
721 aa  657  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.78164e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2510  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.5 
 
 
732 aa  636  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00123268  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1999  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  60.68 
 
 
790 aa  952  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.062239 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1951  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.05 
 
 
726 aa  682  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.67155e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1673  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  61.63 
 
 
781 aa  982  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2116  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  57.95 
 
 
807 aa  894  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0339196  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2297  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  58.11 
 
 
797 aa  897  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149438  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15130  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  54.74 
 
 
812 aa  844  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0120895  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3821  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  53.85 
 
 
787 aa  815  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.438652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12603  GTP pyrophosphokinase relA  55.18 
 
 
790 aa  835  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.42988e-06  normal  0.752099 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  57.97 
 
 
820 aa  899  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.865833  normal  0.439631 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21900  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  45.68 
 
 
789 aa  670  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0842  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  57.62 
 
 
817 aa  892  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461248  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1363  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  61.52 
 
 
804 aa  966  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.401853  normal  0.596174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14010  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  56.38 
 
 
809 aa  887  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.698973  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2720  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.91 
 
 
802 aa  691  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.865135  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2392  RelA/SpoT family protein  56.47 
 
 
743 aa  874  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2587  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  53.97 
 
 
788 aa  830  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.613367 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15280  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  48.67 
 
 
740 aa  718  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2327  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  55.05 
 
 
801 aa  839  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0335883  normal  0.296201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3048  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  59.79 
 
 
815 aa  932  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3609  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.53 
 
 
726 aa  654  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00130344  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4151  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  43.11 
 
 
727 aa  637  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2027  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  57.97 
 
 
763 aa  874  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.74552e-09 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5139  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  54.01 
 
 
879 aa  834  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258236 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0548  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.02 
 
 
813 aa  668  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3812  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  53.9 
 
 
790 aa  827  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.225283  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1801  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  61.27 
 
 
795 aa  959  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.203828  normal  0.0273265 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1945  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  54.59 
 
 
779 aa  837  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.712963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1344  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.38 
 
 
724 aa  655  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.66061e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2090  RelA/SpoT protein  58.11 
 
 
814 aa  907  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0520  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.06 
 
 
781 aa  635  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0839645  hitchhiker  6.97847e-05 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2308  RelA/SpoT family protein  53.99 
 
 
790 aa  819  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0636363  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2058  (p)ppGpp synthetase I  57.57 
 
 
786 aa  902  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.226647  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4491  GTP pyrophosphokinase  43.11 
 
 
727 aa  632  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4140  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  42.98 
 
 
727 aa  630  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4487  GTP diphosphokinase  42.98 
 
 
727 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.80159e-12 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0901  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.22 
 
 
712 aa  629  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0988529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4637  GTP pyrophosphokinase  42.84 
 
 
727 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3123  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.86 
 
 
727 aa  629  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00942759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4541  GTP diphosphokinase  42.98 
 
 
727 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4302  GTP pyrophosphokinase  42.84 
 
 
727 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0379  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.85 
 
 
710 aa  625  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4526  GTP diphosphokinase  42.84 
 
 
727 aa  627  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0939  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.68 
 
 
732 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0709  GTP diphosphokinase  42.84 
 
 
727 aa  627  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.348241  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4254  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.29 
 
 
727 aa  624  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00950275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2284  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.61 
 
 
716 aa  616  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0529541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2236  GTP pyrophosphokinase  43.13 
 
 
716 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0971  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.56 
 
 
727 aa  613  1e-174  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000148672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1400  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.95 
 
 
746 aa  614  1e-174  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3160  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.99 
 
 
716 aa  615  1e-174  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.34468e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2550  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  44.82 
 
 
746 aa  613  1e-174  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1052  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.28 
 
 
716 aa  612  1e-174  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06243e-06 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1299  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.95 
 
 
746 aa  614  1e-174  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1311  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.7 
 
 
738 aa  612  1e-174  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2325  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  42.72 
 
 
716 aa  609  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.3827e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2287  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.55 
 
 
727 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421652  hitchhiker  1.20051e-07 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0998  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.37 
 
 
721 aa  610  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3211  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.93 
 
 
716 aa  612  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00108978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1288  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.7 
 
 
729 aa  606  1e-172  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0314087  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0857  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  41.68 
 
 
750 aa  607  1e-172  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2399  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.93 
 
 
717 aa  602  1e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.088294  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0885  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  40.65 
 
 
733 aa  594  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1724  GTP pyrophosphokinase  41.37 
 
 
729 aa  586  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1691  GTP pyrophosphokinase  41.37 
 
 
729 aa  586  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.599497  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0721  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.78 
 
 
745 aa  587  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  4.59955e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1536  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.95 
 
 
719 aa  583  1e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0587  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  41.88 
 
 
748 aa  573  1e-162  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00257021  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_5  relA/spoT protein, GTP pyrophosphokinase  40.96 
 
 
728 aa  573  1e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1146  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41 
 
 
717 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144176  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0175  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  41.14 
 
 
740 aa  572  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_002936  DET0005  GTP pyrophosphokinase  40.96 
 
 
728 aa  570  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0431  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  40.94 
 
 
715 aa  570  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2057  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.33 
 
 
716 aa  568  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.50061e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>